Protein–RNA interactions for Protein: Q93063

EXT2, Exostosin-2, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT2Q93063 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EXT2Q93063 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EXT2Q93063 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXT2Q93063 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXT2Q93063 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXT2Q93063 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXT2Q93063 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXT2Q93063 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXT2Q93063 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXT2Q93063 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXT2Q93063 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXT2Q93063 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXT2Q93063 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXT2Q93063 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXT2Q93063 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXT2Q93063 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXT2Q93063 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXT2Q93063 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXT2Q93063 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXT2Q93063 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXT2Q93063 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXT2Q93063 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXT2Q93063 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXT2Q93063 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXT2Q93063 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXT2Q93063 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXT2Q93063 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXT2Q93063 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXT2Q93063 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXT2Q93063 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXT2Q93063 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXT2Q93063 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXT2Q93063 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXT2Q93063 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EXT2Q93063 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EXT2Q93063 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EXT2Q93063 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXT2Q93063 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXT2Q93063 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXT2Q93063 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXT2Q93063 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXT2Q93063 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXT2Q93063 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXT2Q93063 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXT2Q93063 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXT2Q93063 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXT2Q93063 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXT2Q93063 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXT2Q93063 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXT2Q93063 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXT2Q93063 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXT2Q93063 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EXT2Q93063 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXT2Q93063 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXT2Q93063 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXT2Q93063 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXT2Q93063 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXT2Q93063 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXT2Q93063 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EXT2Q93063 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXT2Q93063 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXT2Q93063 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXT2Q93063 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXT2Q93063 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXT2Q93063 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms