Protein–RNA interactions for Protein: Q92963

RIT1, GTP-binding protein Rit1, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIT1Q92963 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIT1Q92963 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIT1Q92963 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIT1Q92963 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIT1Q92963 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RIT1Q92963 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIT1Q92963 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIT1Q92963 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIT1Q92963 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIT1Q92963 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIT1Q92963 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIT1Q92963 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIT1Q92963 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIT1Q92963 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIT1Q92963 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIT1Q92963 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIT1Q92963 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIT1Q92963 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RIT1Q92963 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIT1Q92963 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIT1Q92963 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RIT1Q92963 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIT1Q92963 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIT1Q92963 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIT1Q92963 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIT1Q92963 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIT1Q92963 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIT1Q92963 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIT1Q92963 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIT1Q92963 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIT1Q92963 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIT1Q92963 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RIT1Q92963 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIT1Q92963 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIT1Q92963 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIT1Q92963 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIT1Q92963 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIT1Q92963 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIT1Q92963 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIT1Q92963 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIT1Q92963 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIT1Q92963 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIT1Q92963 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIT1Q92963 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIT1Q92963 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIT1Q92963 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIT1Q92963 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIT1Q92963 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIT1Q92963 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIT1Q92963 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIT1Q92963 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIT1Q92963 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIT1Q92963 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIT1Q92963 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIT1Q92963 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIT1Q92963 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIT1Q92963 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIT1Q92963 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIT1Q92963 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIT1Q92963 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIT1Q92963 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIT1Q92963 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIT1Q92963 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIT1Q92963 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIT1Q92963 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIT1Q92963 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIT1Q92963 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIT1Q92963 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIT1Q92963 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIT1Q92963 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RIT1Q92963 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIT1Q92963 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIT1Q92963 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIT1Q92963 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIT1Q92963 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIT1Q92963 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIT1Q92963 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RIT1Q92963 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIT1Q92963 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RIT1Q92963 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIT1Q92963 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIT1Q92963 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIT1Q92963 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIT1Q92963 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIT1Q92963 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIT1Q92963 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIT1Q92963 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RIT1Q92963 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RIT1Q92963 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIT1Q92963 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIT1Q92963 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIT1Q92963 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIT1Q92963 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIT1Q92963 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIT1Q92963 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RIT1Q92963 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIT1Q92963 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIT1Q92963 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIT1Q92963 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIT1Q92963 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms