Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CELF1Q92879 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CELF1Q92879 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CELF1Q92879 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CELF1Q92879 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CELF1Q92879 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CELF1Q92879 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CELF1Q92879 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CELF1Q92879 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CELF1Q92879 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CELF1Q92879 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CELF1Q92879 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CELF1Q92879 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CELF1Q92879 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CELF1Q92879 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CELF1Q92879 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CELF1Q92879 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CELF1Q92879 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CELF1Q92879 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CELF1Q92879 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CELF1Q92879 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CELF1Q92879 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CELF1Q92879 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CELF1Q92879 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CELF1Q92879 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CELF1Q92879 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CELF1Q92879 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CELF1Q92879 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CELF1Q92879 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CELF1Q92879 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CELF1Q92879 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CELF1Q92879 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CELF1Q92879 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CELF1Q92879 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CELF1Q92879 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CELF1Q92879 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CELF1Q92879 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CELF1Q92879 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CELF1Q92879 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CELF1Q92879 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CELF1Q92879 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CELF1Q92879 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CELF1Q92879 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CELF1Q92879 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CELF1Q92879 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CELF1Q92879 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CELF1Q92879 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CELF1Q92879 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CELF1Q92879 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CELF1Q92879 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CELF1Q92879 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CELF1Q92879 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CELF1Q92879 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CELF1Q92879 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CELF1Q92879 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CELF1Q92879 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CELF1Q92879 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CELF1Q92879 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CELF1Q92879 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CELF1Q92879 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CELF1Q92879 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CELF1Q92879 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CELF1Q92879 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CELF1Q92879 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CELF1Q92879 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CELF1Q92879 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CELF1Q92879 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CELF1Q92879 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CELF1Q92879 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CELF1Q92879 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CELF1Q92879 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CELF1Q92879 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CELF1Q92879 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CELF1Q92879 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CELF1Q92879 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CELF1Q92879 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CELF1Q92879 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CELF1Q92879 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CELF1Q92879 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CELF1Q92879 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CELF1Q92879 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CELF1Q92879 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CELF1Q92879 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CELF1Q92879 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CELF1Q92879 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CELF1Q92879 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CELF1Q92879 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CELF1Q92879 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CELF1Q92879 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CELF1Q92879 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CELF1Q92879 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CELF1Q92879 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CELF1Q92879 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CELF1Q92879 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CELF1Q92879 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CELF1Q92879 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CELF1Q92879 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CELF1Q92879 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CELF1Q92879 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CELF1Q92879 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms