Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TTC9Q92623 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TTC9Q92623 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TTC9Q92623 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TTC9Q92623 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC9Q92623 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC9Q92623 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC9Q92623 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC9Q92623 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC9Q92623 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC9Q92623 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC9Q92623 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC9Q92623 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC9Q92623 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC9Q92623 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC9Q92623 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC9Q92623 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC9Q92623 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC9Q92623 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC9Q92623 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC9Q92623 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC9Q92623 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC9Q92623 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC9Q92623 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC9Q92623 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC9Q92623 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC9Q92623 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC9Q92623 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC9Q92623 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC9Q92623 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC9Q92623 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC9Q92623 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC9Q92623 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC9Q92623 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC9Q92623 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC9Q92623 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC9Q92623 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC9Q92623 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC9Q92623 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC9Q92623 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC9Q92623 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC9Q92623 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC9Q92623 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC9Q92623 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC9Q92623 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC9Q92623 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC9Q92623 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC9Q92623 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC9Q92623 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC9Q92623 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC9Q92623 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC9Q92623 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC9Q92623 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC9Q92623 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC9Q92623 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC9Q92623 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC9Q92623 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC9Q92623 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC9Q92623 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC9Q92623 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC9Q92623 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC9Q92623 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC9Q92623 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC9Q92623 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC9Q92623 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC9Q92623 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC9Q92623 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC9Q92623 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC9Q92623 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC9Q92623 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC9Q92623 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC9Q92623 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC9Q92623 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC9Q92623 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC9Q92623 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC9Q92623 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC9Q92623 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC9Q92623 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC9Q92623 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC9Q92623 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC9Q92623 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC9Q92623 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC9Q92623 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC9Q92623 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC9Q92623 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC9Q92623 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC9Q92623 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC9Q92623 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC9Q92623 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC9Q92623 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC9Q92623 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC9Q92623 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC9Q92623 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC9Q92623 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC9Q92623 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC9Q92623 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC9Q92623 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC9Q92623 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC9Q92623 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC9Q92623 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms