Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
TOPBP1Q92547 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.21
TOPBP1Q92547 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC41.32■■■■■ 4.2
TOPBP1Q92547 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.2
TOPBP1Q92547 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC41.32■■■■■ 4.2
TOPBP1Q92547 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
TOPBP1Q92547 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC41.31■■■■■ 4.2
TOPBP1Q92547 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC41.31■■■■■ 4.2
TOPBP1Q92547 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC41.31■■■■■ 4.2
TOPBP1Q92547 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
TOPBP1Q92547 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
TOPBP1Q92547 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC41.3■■■■■ 4.2
TOPBP1Q92547 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
TOPBP1Q92547 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
TOPBP1Q92547 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC41.29■■■■■ 4.2
TOPBP1Q92547 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
TOPBP1Q92547 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
TOPBP1Q92547 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
TOPBP1Q92547 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC41.28■■■■■ 4.2
TOPBP1Q92547 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC41.28■■■■■ 4.2
TOPBP1Q92547 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
TOPBP1Q92547 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
TOPBP1Q92547 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
TOPBP1Q92547 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC41.26■■■■■ 4.2
TOPBP1Q92547 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
TOPBP1Q92547 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.2
TOPBP1Q92547 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.19
TOPBP1Q92547 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
TOPBP1Q92547 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
TOPBP1Q92547 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
TOPBP1Q92547 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC41.24■■■■■ 4.19
TOPBP1Q92547 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
TOPBP1Q92547 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
TOPBP1Q92547 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC41.23■■■■■ 4.19
TOPBP1Q92547 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
TOPBP1Q92547 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
TOPBP1Q92547 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
TOPBP1Q92547 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC41.23■■■■■ 4.19
TOPBP1Q92547 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC41.23■■■■■ 4.19
TOPBP1Q92547 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
TOPBP1Q92547 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC41.22■■■■■ 4.19
TOPBP1Q92547 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
TOPBP1Q92547 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC41.21■■■■■ 4.19
TOPBP1Q92547 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
TOPBP1Q92547 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
TOPBP1Q92547 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
TOPBP1Q92547 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
TOPBP1Q92547 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
TOPBP1Q92547 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
TOPBP1Q92547 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.19
TOPBP1Q92547 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
TOPBP1Q92547 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.19■■■■■ 4.18
TOPBP1Q92547 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
TOPBP1Q92547 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
TOPBP1Q92547 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC41.18■■■■■ 4.18
TOPBP1Q92547 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC41.18■■■■■ 4.18
TOPBP1Q92547 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
TOPBP1Q92547 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
TOPBP1Q92547 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
TOPBP1Q92547 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
TOPBP1Q92547 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
TOPBP1Q92547 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
TOPBP1Q92547 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC41.18■■■■■ 4.18
TOPBP1Q92547 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
TOPBP1Q92547 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
TOPBP1Q92547 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
TOPBP1Q92547 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
TOPBP1Q92547 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
TOPBP1Q92547 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC41.16■■■■■ 4.18
TOPBP1Q92547 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
TOPBP1Q92547 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
TOPBP1Q92547 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC41.15■■■■■ 4.18
TOPBP1Q92547 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
TOPBP1Q92547 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
TOPBP1Q92547 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
TOPBP1Q92547 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.17
TOPBP1Q92547 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC41.13■■■■■ 4.17
TOPBP1Q92547 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
TOPBP1Q92547 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
TOPBP1Q92547 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
TOPBP1Q92547 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
TOPBP1Q92547 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
TOPBP1Q92547 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
TOPBP1Q92547 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
TOPBP1Q92547 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC41.11■■■■■ 4.17
TOPBP1Q92547 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC41.11■■■■■ 4.17
TOPBP1Q92547 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
TOPBP1Q92547 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
TOPBP1Q92547 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
TOPBP1Q92547 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
TOPBP1Q92547 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC41.09■■■■■ 4.17
TOPBP1Q92547 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
TOPBP1Q92547 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
TOPBP1Q92547 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC41.08■■■■■ 4.17
TOPBP1Q92547 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
TOPBP1Q92547 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
TOPBP1Q92547 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
TOPBP1Q92547 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC41.08■■■■■ 4.17
TOPBP1Q92547 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
TOPBP1Q92547 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC41.07■■■■■ 4.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms