Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHY6

ZFP28, Zinc finger protein 28 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFP28Q8NHY6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZFP28Q8NHY6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ZFP28Q8NHY6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.2 ms