Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDF8

PAPD5, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPD5Q8NDF8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPD5Q8NDF8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPD5Q8NDF8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPD5Q8NDF8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPD5Q8NDF8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPD5Q8NDF8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPD5Q8NDF8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPD5Q8NDF8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAPD5Q8NDF8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAPD5Q8NDF8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAPD5Q8NDF8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAPD5Q8NDF8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAPD5Q8NDF8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAPD5Q8NDF8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAPD5Q8NDF8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAPD5Q8NDF8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPD5Q8NDF8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPD5Q8NDF8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPD5Q8NDF8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAPD5Q8NDF8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAPD5Q8NDF8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAPD5Q8NDF8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAPD5Q8NDF8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAPD5Q8NDF8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAPD5Q8NDF8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPD5Q8NDF8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPD5Q8NDF8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPD5Q8NDF8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPD5Q8NDF8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPD5Q8NDF8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPD5Q8NDF8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPD5Q8NDF8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPD5Q8NDF8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPD5Q8NDF8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPD5Q8NDF8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPD5Q8NDF8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPD5Q8NDF8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPD5Q8NDF8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPD5Q8NDF8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPD5Q8NDF8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAPD5Q8NDF8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAPD5Q8NDF8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PAPD5Q8NDF8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAPD5Q8NDF8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAPD5Q8NDF8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAPD5Q8NDF8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAPD5Q8NDF8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAPD5Q8NDF8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAPD5Q8NDF8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAPD5Q8NDF8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAPD5Q8NDF8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PAPD5Q8NDF8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAPD5Q8NDF8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAPD5Q8NDF8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAPD5Q8NDF8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAPD5Q8NDF8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAPD5Q8NDF8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PAPD5Q8NDF8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAPD5Q8NDF8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAPD5Q8NDF8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAPD5Q8NDF8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAPD5Q8NDF8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAPD5Q8NDF8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAPD5Q8NDF8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAPD5Q8NDF8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAPD5Q8NDF8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAPD5Q8NDF8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAPD5Q8NDF8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAPD5Q8NDF8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAPD5Q8NDF8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PAPD5Q8NDF8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PAPD5Q8NDF8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PAPD5Q8NDF8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PAPD5Q8NDF8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PAPD5Q8NDF8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PAPD5Q8NDF8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAPD5Q8NDF8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAPD5Q8NDF8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAPD5Q8NDF8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAPD5Q8NDF8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAPD5Q8NDF8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAPD5Q8NDF8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAPD5Q8NDF8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAPD5Q8NDF8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAPD5Q8NDF8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAPD5Q8NDF8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAPD5Q8NDF8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAPD5Q8NDF8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAPD5Q8NDF8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAPD5Q8NDF8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAPD5Q8NDF8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAPD5Q8NDF8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAPD5Q8NDF8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAPD5Q8NDF8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAPD5Q8NDF8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAPD5Q8NDF8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAPD5Q8NDF8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAPD5Q8NDF8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAPD5Q8NDF8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PAPD5Q8NDF8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms