Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA29

MFSD2A, Sodium-dependent lysophosphatidylcholine symporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD2AQ8NA29 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MFSD2AQ8NA29 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MFSD2AQ8NA29 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MFSD2AQ8NA29 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MFSD2AQ8NA29 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MFSD2AQ8NA29 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MFSD2AQ8NA29 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MFSD2AQ8NA29 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MFSD2AQ8NA29 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MFSD2AQ8NA29 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MFSD2AQ8NA29 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MFSD2AQ8NA29 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MFSD2AQ8NA29 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MFSD2AQ8NA29 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MFSD2AQ8NA29 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MFSD2AQ8NA29 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MFSD2AQ8NA29 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MFSD2AQ8NA29 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MFSD2AQ8NA29 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MFSD2AQ8NA29 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MFSD2AQ8NA29 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MFSD2AQ8NA29 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MFSD2AQ8NA29 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MFSD2AQ8NA29 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MFSD2AQ8NA29 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MFSD2AQ8NA29 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MFSD2AQ8NA29 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MFSD2AQ8NA29 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MFSD2AQ8NA29 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MFSD2AQ8NA29 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MFSD2AQ8NA29 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MFSD2AQ8NA29 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MFSD2AQ8NA29 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MFSD2AQ8NA29 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MFSD2AQ8NA29 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MFSD2AQ8NA29 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MFSD2AQ8NA29 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MFSD2AQ8NA29 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MFSD2AQ8NA29 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MFSD2AQ8NA29 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MFSD2AQ8NA29 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MFSD2AQ8NA29 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MFSD2AQ8NA29 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MFSD2AQ8NA29 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MFSD2AQ8NA29 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MFSD2AQ8NA29 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MFSD2AQ8NA29 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MFSD2AQ8NA29 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MFSD2AQ8NA29 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MFSD2AQ8NA29 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MFSD2AQ8NA29 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MFSD2AQ8NA29 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MFSD2AQ8NA29 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MFSD2AQ8NA29 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MFSD2AQ8NA29 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MFSD2AQ8NA29 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MFSD2AQ8NA29 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MFSD2AQ8NA29 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MFSD2AQ8NA29 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MFSD2AQ8NA29 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MFSD2AQ8NA29 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MFSD2AQ8NA29 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MFSD2AQ8NA29 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MFSD2AQ8NA29 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MFSD2AQ8NA29 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MFSD2AQ8NA29 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MFSD2AQ8NA29 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MFSD2AQ8NA29 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MFSD2AQ8NA29 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MFSD2AQ8NA29 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MFSD2AQ8NA29 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MFSD2AQ8NA29 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MFSD2AQ8NA29 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MFSD2AQ8NA29 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MFSD2AQ8NA29 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MFSD2AQ8NA29 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MFSD2AQ8NA29 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MFSD2AQ8NA29 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MFSD2AQ8NA29 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MFSD2AQ8NA29 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MFSD2AQ8NA29 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MFSD2AQ8NA29 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MFSD2AQ8NA29 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MFSD2AQ8NA29 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MFSD2AQ8NA29 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MFSD2AQ8NA29 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MFSD2AQ8NA29 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MFSD2AQ8NA29 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MFSD2AQ8NA29 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MFSD2AQ8NA29 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MFSD2AQ8NA29 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MFSD2AQ8NA29 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MFSD2AQ8NA29 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MFSD2AQ8NA29 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MFSD2AQ8NA29 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MFSD2AQ8NA29 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MFSD2AQ8NA29 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MFSD2AQ8NA29 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MFSD2AQ8NA29 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MFSD2AQ8NA29 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms