Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZIC4Q8N9L1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZIC4Q8N9L1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZIC4Q8N9L1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZIC4Q8N9L1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZIC4Q8N9L1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZIC4Q8N9L1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZIC4Q8N9L1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZIC4Q8N9L1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZIC4Q8N9L1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZIC4Q8N9L1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZIC4Q8N9L1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZIC4Q8N9L1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZIC4Q8N9L1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZIC4Q8N9L1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZIC4Q8N9L1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZIC4Q8N9L1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZIC4Q8N9L1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZIC4Q8N9L1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZIC4Q8N9L1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZIC4Q8N9L1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZIC4Q8N9L1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZIC4Q8N9L1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZIC4Q8N9L1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZIC4Q8N9L1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZIC4Q8N9L1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZIC4Q8N9L1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZIC4Q8N9L1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZIC4Q8N9L1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZIC4Q8N9L1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZIC4Q8N9L1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ZIC4Q8N9L1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZIC4Q8N9L1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZIC4Q8N9L1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ZIC4Q8N9L1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZIC4Q8N9L1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZIC4Q8N9L1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ZIC4Q8N9L1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZIC4Q8N9L1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZIC4Q8N9L1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZIC4Q8N9L1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZIC4Q8N9L1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZIC4Q8N9L1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZIC4Q8N9L1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZIC4Q8N9L1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZIC4Q8N9L1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZIC4Q8N9L1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZIC4Q8N9L1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZIC4Q8N9L1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZIC4Q8N9L1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZIC4Q8N9L1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZIC4Q8N9L1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZIC4Q8N9L1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZIC4Q8N9L1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZIC4Q8N9L1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZIC4Q8N9L1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZIC4Q8N9L1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZIC4Q8N9L1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZIC4Q8N9L1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZIC4Q8N9L1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZIC4Q8N9L1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZIC4Q8N9L1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZIC4Q8N9L1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZIC4Q8N9L1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZIC4Q8N9L1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZIC4Q8N9L1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZIC4Q8N9L1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZIC4Q8N9L1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZIC4Q8N9L1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZIC4Q8N9L1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZIC4Q8N9L1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZIC4Q8N9L1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZIC4Q8N9L1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZIC4Q8N9L1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZIC4Q8N9L1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZIC4Q8N9L1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZIC4Q8N9L1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZIC4Q8N9L1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZIC4Q8N9L1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZIC4Q8N9L1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZIC4Q8N9L1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZIC4Q8N9L1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZIC4Q8N9L1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZIC4Q8N9L1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZIC4Q8N9L1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZIC4Q8N9L1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZIC4Q8N9L1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZIC4Q8N9L1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZIC4Q8N9L1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZIC4Q8N9L1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZIC4Q8N9L1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZIC4Q8N9L1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZIC4Q8N9L1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZIC4Q8N9L1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZIC4Q8N9L1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZIC4Q8N9L1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZIC4Q8N9L1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZIC4Q8N9L1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZIC4Q8N9L1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZIC4Q8N9L1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms