Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8G6

C15orf54, Putative uncharacterized protein C15orf54, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf54Q8N8G6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C15orf54Q8N8G6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C15orf54Q8N8G6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C15orf54Q8N8G6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C15orf54Q8N8G6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C15orf54Q8N8G6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
C15orf54Q8N8G6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C15orf54Q8N8G6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C15orf54Q8N8G6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C15orf54Q8N8G6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C15orf54Q8N8G6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C15orf54Q8N8G6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C15orf54Q8N8G6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C15orf54Q8N8G6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C15orf54Q8N8G6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C15orf54Q8N8G6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C15orf54Q8N8G6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C15orf54Q8N8G6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C15orf54Q8N8G6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
C15orf54Q8N8G6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C15orf54Q8N8G6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C15orf54Q8N8G6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C15orf54Q8N8G6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C15orf54Q8N8G6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C15orf54Q8N8G6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C15orf54Q8N8G6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C15orf54Q8N8G6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C15orf54Q8N8G6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C15orf54Q8N8G6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C15orf54Q8N8G6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C15orf54Q8N8G6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
C15orf54Q8N8G6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C15orf54Q8N8G6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C15orf54Q8N8G6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C15orf54Q8N8G6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C15orf54Q8N8G6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C15orf54Q8N8G6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C15orf54Q8N8G6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
C15orf54Q8N8G6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
C15orf54Q8N8G6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C15orf54Q8N8G6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms