Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX30

SCUBE3, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE3Q8IX30 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCUBE3Q8IX30 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCUBE3Q8IX30 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCUBE3Q8IX30 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCUBE3Q8IX30 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCUBE3Q8IX30 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCUBE3Q8IX30 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCUBE3Q8IX30 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCUBE3Q8IX30 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCUBE3Q8IX30 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SCUBE3Q8IX30 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCUBE3Q8IX30 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCUBE3Q8IX30 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCUBE3Q8IX30 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCUBE3Q8IX30 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCUBE3Q8IX30 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SCUBE3Q8IX30 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCUBE3Q8IX30 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCUBE3Q8IX30 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCUBE3Q8IX30 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCUBE3Q8IX30 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SCUBE3Q8IX30 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCUBE3Q8IX30 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCUBE3Q8IX30 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCUBE3Q8IX30 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCUBE3Q8IX30 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCUBE3Q8IX30 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCUBE3Q8IX30 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCUBE3Q8IX30 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCUBE3Q8IX30 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCUBE3Q8IX30 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCUBE3Q8IX30 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCUBE3Q8IX30 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCUBE3Q8IX30 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCUBE3Q8IX30 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCUBE3Q8IX30 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCUBE3Q8IX30 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCUBE3Q8IX30 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCUBE3Q8IX30 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCUBE3Q8IX30 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCUBE3Q8IX30 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCUBE3Q8IX30 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCUBE3Q8IX30 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SCUBE3Q8IX30 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCUBE3Q8IX30 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCUBE3Q8IX30 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCUBE3Q8IX30 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCUBE3Q8IX30 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCUBE3Q8IX30 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCUBE3Q8IX30 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCUBE3Q8IX30 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCUBE3Q8IX30 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCUBE3Q8IX30 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCUBE3Q8IX30 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCUBE3Q8IX30 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCUBE3Q8IX30 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCUBE3Q8IX30 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCUBE3Q8IX30 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCUBE3Q8IX30 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCUBE3Q8IX30 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCUBE3Q8IX30 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCUBE3Q8IX30 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCUBE3Q8IX30 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SCUBE3Q8IX30 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCUBE3Q8IX30 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCUBE3Q8IX30 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCUBE3Q8IX30 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCUBE3Q8IX30 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCUBE3Q8IX30 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCUBE3Q8IX30 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCUBE3Q8IX30 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCUBE3Q8IX30 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCUBE3Q8IX30 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCUBE3Q8IX30 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCUBE3Q8IX30 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCUBE3Q8IX30 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCUBE3Q8IX30 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SCUBE3Q8IX30 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SCUBE3Q8IX30 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCUBE3Q8IX30 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCUBE3Q8IX30 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCUBE3Q8IX30 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCUBE3Q8IX30 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCUBE3Q8IX30 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCUBE3Q8IX30 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCUBE3Q8IX30 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SCUBE3Q8IX30 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SCUBE3Q8IX30 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCUBE3Q8IX30 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCUBE3Q8IX30 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCUBE3Q8IX30 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCUBE3Q8IX30 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SCUBE3Q8IX30 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCUBE3Q8IX30 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCUBE3Q8IX30 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCUBE3Q8IX30 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SCUBE3Q8IX30 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCUBE3Q8IX30 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCUBE3Q8IX30 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCUBE3Q8IX30 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms