Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT3

CUL9, Cullin-9, humanhuman

Predictions only

Length 2,517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL9Q8IWT3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUL9Q8IWT3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUL9Q8IWT3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUL9Q8IWT3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CUL9Q8IWT3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUL9Q8IWT3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUL9Q8IWT3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUL9Q8IWT3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUL9Q8IWT3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUL9Q8IWT3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUL9Q8IWT3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUL9Q8IWT3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CUL9Q8IWT3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUL9Q8IWT3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUL9Q8IWT3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUL9Q8IWT3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUL9Q8IWT3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CUL9Q8IWT3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CUL9Q8IWT3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CUL9Q8IWT3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CUL9Q8IWT3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CUL9Q8IWT3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CUL9Q8IWT3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CUL9Q8IWT3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CUL9Q8IWT3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CUL9Q8IWT3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CUL9Q8IWT3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CUL9Q8IWT3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CUL9Q8IWT3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CUL9Q8IWT3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CUL9Q8IWT3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CUL9Q8IWT3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CUL9Q8IWT3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CUL9Q8IWT3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CUL9Q8IWT3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CUL9Q8IWT3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CUL9Q8IWT3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CUL9Q8IWT3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CUL9Q8IWT3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CUL9Q8IWT3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CUL9Q8IWT3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CUL9Q8IWT3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CUL9Q8IWT3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CUL9Q8IWT3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CUL9Q8IWT3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CUL9Q8IWT3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CUL9Q8IWT3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CUL9Q8IWT3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CUL9Q8IWT3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CUL9Q8IWT3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CUL9Q8IWT3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CUL9Q8IWT3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CUL9Q8IWT3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CUL9Q8IWT3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CUL9Q8IWT3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CUL9Q8IWT3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CUL9Q8IWT3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CUL9Q8IWT3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CUL9Q8IWT3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CUL9Q8IWT3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CUL9Q8IWT3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CUL9Q8IWT3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CUL9Q8IWT3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CUL9Q8IWT3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CUL9Q8IWT3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CUL9Q8IWT3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CUL9Q8IWT3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CUL9Q8IWT3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CUL9Q8IWT3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CUL9Q8IWT3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CUL9Q8IWT3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CUL9Q8IWT3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CUL9Q8IWT3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CUL9Q8IWT3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CUL9Q8IWT3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CUL9Q8IWT3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CUL9Q8IWT3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CUL9Q8IWT3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CUL9Q8IWT3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CUL9Q8IWT3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CUL9Q8IWT3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CUL9Q8IWT3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CUL9Q8IWT3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CUL9Q8IWT3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CUL9Q8IWT3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CUL9Q8IWT3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CUL9Q8IWT3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CUL9Q8IWT3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CUL9Q8IWT3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CUL9Q8IWT3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CUL9Q8IWT3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CUL9Q8IWT3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CUL9Q8IWT3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CUL9Q8IWT3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CUL9Q8IWT3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CUL9Q8IWT3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CUL9Q8IWT3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CUL9Q8IWT3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CUL9Q8IWT3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CUL9Q8IWT3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms