Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV76

PASD1, Circadian clock protein PASD1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PASD1Q8IV76 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PASD1Q8IV76 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PASD1Q8IV76 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PASD1Q8IV76 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PASD1Q8IV76 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PASD1Q8IV76 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PASD1Q8IV76 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PASD1Q8IV76 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PASD1Q8IV76 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PASD1Q8IV76 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PASD1Q8IV76 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PASD1Q8IV76 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PASD1Q8IV76 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PASD1Q8IV76 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PASD1Q8IV76 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PASD1Q8IV76 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PASD1Q8IV76 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PASD1Q8IV76 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PASD1Q8IV76 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PASD1Q8IV76 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PASD1Q8IV76 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PASD1Q8IV76 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PASD1Q8IV76 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PASD1Q8IV76 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PASD1Q8IV76 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PASD1Q8IV76 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PASD1Q8IV76 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PASD1Q8IV76 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PASD1Q8IV76 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PASD1Q8IV76 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PASD1Q8IV76 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PASD1Q8IV76 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PASD1Q8IV76 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PASD1Q8IV76 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PASD1Q8IV76 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PASD1Q8IV76 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PASD1Q8IV76 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PASD1Q8IV76 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PASD1Q8IV76 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PASD1Q8IV76 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PASD1Q8IV76 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PASD1Q8IV76 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PASD1Q8IV76 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PASD1Q8IV76 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PASD1Q8IV76 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PASD1Q8IV76 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PASD1Q8IV76 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PASD1Q8IV76 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PASD1Q8IV76 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PASD1Q8IV76 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PASD1Q8IV76 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PASD1Q8IV76 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PASD1Q8IV76 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PASD1Q8IV76 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PASD1Q8IV76 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PASD1Q8IV76 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PASD1Q8IV76 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PASD1Q8IV76 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PASD1Q8IV76 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PASD1Q8IV76 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PASD1Q8IV76 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PASD1Q8IV76 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PASD1Q8IV76 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PASD1Q8IV76 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PASD1Q8IV76 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PASD1Q8IV76 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PASD1Q8IV76 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PASD1Q8IV76 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PASD1Q8IV76 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PASD1Q8IV76 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PASD1Q8IV76 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PASD1Q8IV76 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PASD1Q8IV76 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PASD1Q8IV76 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PASD1Q8IV76 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PASD1Q8IV76 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PASD1Q8IV76 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PASD1Q8IV76 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PASD1Q8IV76 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PASD1Q8IV76 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PASD1Q8IV76 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PASD1Q8IV76 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PASD1Q8IV76 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PASD1Q8IV76 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PASD1Q8IV76 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PASD1Q8IV76 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PASD1Q8IV76 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PASD1Q8IV76 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PASD1Q8IV76 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PASD1Q8IV76 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PASD1Q8IV76 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PASD1Q8IV76 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PASD1Q8IV76 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PASD1Q8IV76 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PASD1Q8IV76 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PASD1Q8IV76 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PASD1Q8IV76 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PASD1Q8IV76 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PASD1Q8IV76 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PASD1Q8IV76 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms