Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV31

TMEM139, Transmembrane protein 139, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM139Q8IV31 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM139Q8IV31 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM139Q8IV31 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM139Q8IV31 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM139Q8IV31 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM139Q8IV31 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM139Q8IV31 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM139Q8IV31 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM139Q8IV31 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM139Q8IV31 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM139Q8IV31 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM139Q8IV31 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM139Q8IV31 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM139Q8IV31 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM139Q8IV31 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM139Q8IV31 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM139Q8IV31 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM139Q8IV31 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM139Q8IV31 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM139Q8IV31 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM139Q8IV31 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM139Q8IV31 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM139Q8IV31 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM139Q8IV31 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM139Q8IV31 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM139Q8IV31 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM139Q8IV31 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM139Q8IV31 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM139Q8IV31 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM139Q8IV31 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM139Q8IV31 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM139Q8IV31 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM139Q8IV31 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM139Q8IV31 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM139Q8IV31 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM139Q8IV31 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM139Q8IV31 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM139Q8IV31 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM139Q8IV31 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM139Q8IV31 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM139Q8IV31 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM139Q8IV31 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM139Q8IV31 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM139Q8IV31 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM139Q8IV31 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM139Q8IV31 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM139Q8IV31 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM139Q8IV31 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM139Q8IV31 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM139Q8IV31 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM139Q8IV31 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM139Q8IV31 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM139Q8IV31 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM139Q8IV31 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM139Q8IV31 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM139Q8IV31 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM139Q8IV31 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM139Q8IV31 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM139Q8IV31 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM139Q8IV31 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM139Q8IV31 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM139Q8IV31 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM139Q8IV31 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM139Q8IV31 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM139Q8IV31 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM139Q8IV31 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM139Q8IV31 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM139Q8IV31 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM139Q8IV31 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMEM139Q8IV31 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMEM139Q8IV31 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM139Q8IV31 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM139Q8IV31 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM139Q8IV31 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM139Q8IV31 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM139Q8IV31 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM139Q8IV31 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM139Q8IV31 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM139Q8IV31 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM139Q8IV31 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM139Q8IV31 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM139Q8IV31 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM139Q8IV31 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM139Q8IV31 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM139Q8IV31 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM139Q8IV31 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM139Q8IV31 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM139Q8IV31 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM139Q8IV31 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM139Q8IV31 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM139Q8IV31 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM139Q8IV31 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM139Q8IV31 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM139Q8IV31 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM139Q8IV31 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM139Q8IV31 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM139Q8IV31 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM139Q8IV31 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM139Q8IV31 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM139Q8IV31 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms