Protein–RNA interactions for Protein: Q86YV9

HPS6, Hermansky-Pudlak syndrome 6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS6Q86YV9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPS6Q86YV9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPS6Q86YV9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPS6Q86YV9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPS6Q86YV9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPS6Q86YV9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPS6Q86YV9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS6Q86YV9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS6Q86YV9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS6Q86YV9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS6Q86YV9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS6Q86YV9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS6Q86YV9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS6Q86YV9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS6Q86YV9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS6Q86YV9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS6Q86YV9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS6Q86YV9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS6Q86YV9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS6Q86YV9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS6Q86YV9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS6Q86YV9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS6Q86YV9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPS6Q86YV9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPS6Q86YV9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPS6Q86YV9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPS6Q86YV9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPS6Q86YV9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HPS6Q86YV9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HPS6Q86YV9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HPS6Q86YV9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HPS6Q86YV9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HPS6Q86YV9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HPS6Q86YV9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HPS6Q86YV9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HPS6Q86YV9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HPS6Q86YV9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HPS6Q86YV9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HPS6Q86YV9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS6Q86YV9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS6Q86YV9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS6Q86YV9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS6Q86YV9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS6Q86YV9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS6Q86YV9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS6Q86YV9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS6Q86YV9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS6Q86YV9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS6Q86YV9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS6Q86YV9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS6Q86YV9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS6Q86YV9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS6Q86YV9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS6Q86YV9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS6Q86YV9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS6Q86YV9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS6Q86YV9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS6Q86YV9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS6Q86YV9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS6Q86YV9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS6Q86YV9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS6Q86YV9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS6Q86YV9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS6Q86YV9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS6Q86YV9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPS6Q86YV9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPS6Q86YV9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPS6Q86YV9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS6Q86YV9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS6Q86YV9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS6Q86YV9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS6Q86YV9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS6Q86YV9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS6Q86YV9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS6Q86YV9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS6Q86YV9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS6Q86YV9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS6Q86YV9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HPS6Q86YV9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPS6Q86YV9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPS6Q86YV9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HPS6Q86YV9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPS6Q86YV9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPS6Q86YV9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPS6Q86YV9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HPS6Q86YV9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS6Q86YV9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS6Q86YV9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS6Q86YV9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS6Q86YV9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS6Q86YV9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS6Q86YV9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS6Q86YV9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS6Q86YV9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS6Q86YV9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS6Q86YV9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS6Q86YV9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS6Q86YV9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS6Q86YV9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS6Q86YV9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms