Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z392

TRAPPC11, Trafficking protein particle complex subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11Q7Z392 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC11Q7Z392 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC11Q7Z392 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC11Q7Z392 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC11Q7Z392 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC11Q7Z392 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC11Q7Z392 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC11Q7Z392 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC11Q7Z392 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC11Q7Z392 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC11Q7Z392 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC11Q7Z392 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC11Q7Z392 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC11Q7Z392 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC11Q7Z392 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC11Q7Z392 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC11Q7Z392 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC11Q7Z392 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC11Q7Z392 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC11Q7Z392 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC11Q7Z392 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC11Q7Z392 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC11Q7Z392 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC11Q7Z392 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC11Q7Z392 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC11Q7Z392 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC11Q7Z392 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC11Q7Z392 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC11Q7Z392 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC11Q7Z392 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC11Q7Z392 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC11Q7Z392 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC11Q7Z392 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC11Q7Z392 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC11Q7Z392 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC11Q7Z392 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC11Q7Z392 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC11Q7Z392 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC11Q7Z392 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC11Q7Z392 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC11Q7Z392 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC11Q7Z392 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC11Q7Z392 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC11Q7Z392 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC11Q7Z392 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC11Q7Z392 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC11Q7Z392 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC11Q7Z392 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC11Q7Z392 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC11Q7Z392 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC11Q7Z392 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC11Q7Z392 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC11Q7Z392 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC11Q7Z392 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC11Q7Z392 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC11Q7Z392 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC11Q7Z392 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC11Q7Z392 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC11Q7Z392 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC11Q7Z392 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC11Q7Z392 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC11Q7Z392 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC11Q7Z392 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC11Q7Z392 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC11Q7Z392 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC11Q7Z392 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC11Q7Z392 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC11Q7Z392 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC11Q7Z392 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC11Q7Z392 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC11Q7Z392 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC11Q7Z392 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC11Q7Z392 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC11Q7Z392 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC11Q7Z392 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC11Q7Z392 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC11Q7Z392 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC11Q7Z392 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC11Q7Z392 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC11Q7Z392 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC11Q7Z392 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRAPPC11Q7Z392 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRAPPC11Q7Z392 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC11Q7Z392 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC11Q7Z392 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC11Q7Z392 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC11Q7Z392 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC11Q7Z392 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC11Q7Z392 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC11Q7Z392 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC11Q7Z392 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC11Q7Z392 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC11Q7Z392 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC11Q7Z392 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC11Q7Z392 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC11Q7Z392 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC11Q7Z392 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC11Q7Z392 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC11Q7Z392 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC11Q7Z392 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 247.2 ms