Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GDPD3Q7L5L3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GDPD3Q7L5L3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GDPD3Q7L5L3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GDPD3Q7L5L3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GDPD3Q7L5L3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GDPD3Q7L5L3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GDPD3Q7L5L3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GDPD3Q7L5L3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GDPD3Q7L5L3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GDPD3Q7L5L3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GDPD3Q7L5L3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GDPD3Q7L5L3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GDPD3Q7L5L3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GDPD3Q7L5L3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GDPD3Q7L5L3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GDPD3Q7L5L3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GDPD3Q7L5L3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GDPD3Q7L5L3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GDPD3Q7L5L3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GDPD3Q7L5L3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GDPD3Q7L5L3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GDPD3Q7L5L3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GDPD3Q7L5L3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GDPD3Q7L5L3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GDPD3Q7L5L3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GDPD3Q7L5L3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GDPD3Q7L5L3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GDPD3Q7L5L3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDPD3Q7L5L3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDPD3Q7L5L3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDPD3Q7L5L3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDPD3Q7L5L3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GDPD3Q7L5L3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GDPD3Q7L5L3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GDPD3Q7L5L3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
GDPD3Q7L5L3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GDPD3Q7L5L3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GDPD3Q7L5L3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDPD3Q7L5L3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDPD3Q7L5L3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GDPD3Q7L5L3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDPD3Q7L5L3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GDPD3Q7L5L3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms