Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FOXD4L3Q6VB84 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FOXD4L3Q6VB84 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FOXD4L3Q6VB84 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FOXD4L3Q6VB84 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FOXD4L3Q6VB84 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FOXD4L3Q6VB84 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FOXD4L3Q6VB84 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FOXD4L3Q6VB84 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FOXD4L3Q6VB84 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FOXD4L3Q6VB84 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FOXD4L3Q6VB84 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FOXD4L3Q6VB84 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FOXD4L3Q6VB84 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FOXD4L3Q6VB84 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
FOXD4L3Q6VB84 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
FOXD4L3Q6VB84 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FOXD4L3Q6VB84 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FOXD4L3Q6VB84 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FOXD4L3Q6VB84 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FOXD4L3Q6VB84 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FOXD4L3Q6VB84 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FOXD4L3Q6VB84 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FOXD4L3Q6VB84 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
FOXD4L3Q6VB84 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FOXD4L3Q6VB84 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FOXD4L3Q6VB84 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FOXD4L3Q6VB84 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FOXD4L3Q6VB84 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FOXD4L3Q6VB84 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FOXD4L3Q6VB84 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FOXD4L3Q6VB84 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FOXD4L3Q6VB84 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FOXD4L3Q6VB84 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FOXD4L3Q6VB84 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FOXD4L3Q6VB84 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FOXD4L3Q6VB84 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FOXD4L3Q6VB84 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FOXD4L3Q6VB84 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
FOXD4L3Q6VB84 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FOXD4L3Q6VB84 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FOXD4L3Q6VB84 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FOXD4L3Q6VB84 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FOXD4L3Q6VB84 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FOXD4L3Q6VB84 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FOXD4L3Q6VB84 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FOXD4L3Q6VB84 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FOXD4L3Q6VB84 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
FOXD4L3Q6VB84 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FOXD4L3Q6VB84 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FOXD4L3Q6VB84 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FOXD4L3Q6VB84 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FOXD4L3Q6VB84 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FOXD4L3Q6VB84 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FOXD4L3Q6VB84 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FOXD4L3Q6VB84 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FOXD4L3Q6VB84 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FOXD4L3Q6VB84 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FOXD4L3Q6VB84 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FOXD4L3Q6VB84 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FOXD4L3Q6VB84 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FOXD4L3Q6VB84 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FOXD4L3Q6VB84 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FOXD4L3Q6VB84 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FOXD4L3Q6VB84 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FOXD4L3Q6VB84 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXD4L3Q6VB84 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXD4L3Q6VB84 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXD4L3Q6VB84 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXD4L3Q6VB84 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXD4L3Q6VB84 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXD4L3Q6VB84 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXD4L3Q6VB84 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXD4L3Q6VB84 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXD4L3Q6VB84 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXD4L3Q6VB84 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXD4L3Q6VB84 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXD4L3Q6VB84 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXD4L3Q6VB84 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXD4L3Q6VB84 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXD4L3Q6VB84 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXD4L3Q6VB84 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXD4L3Q6VB84 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXD4L3Q6VB84 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXD4L3Q6VB84 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
FOXD4L3Q6VB84 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FOXD4L3Q6VB84 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FOXD4L3Q6VB84 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXD4L3Q6VB84 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXD4L3Q6VB84 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXD4L3Q6VB84 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXD4L3Q6VB84 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXD4L3Q6VB84 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXD4L3Q6VB84 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXD4L3Q6VB84 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXD4L3Q6VB84 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXD4L3Q6VB84 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXD4L3Q6VB84 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXD4L3Q6VB84 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXD4L3Q6VB84 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms