Protein–RNA interactions for Protein: Q6UB28

METAP1D, Methionine aminopeptidase 1D, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
METAP1DQ6UB28 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
METAP1DQ6UB28 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
METAP1DQ6UB28 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
METAP1DQ6UB28 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
METAP1DQ6UB28 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
METAP1DQ6UB28 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
METAP1DQ6UB28 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
METAP1DQ6UB28 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
METAP1DQ6UB28 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
METAP1DQ6UB28 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
METAP1DQ6UB28 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
METAP1DQ6UB28 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
METAP1DQ6UB28 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
METAP1DQ6UB28 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
METAP1DQ6UB28 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
METAP1DQ6UB28 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
METAP1DQ6UB28 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
METAP1DQ6UB28 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
METAP1DQ6UB28 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
METAP1DQ6UB28 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
METAP1DQ6UB28 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
METAP1DQ6UB28 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
METAP1DQ6UB28 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
METAP1DQ6UB28 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
METAP1DQ6UB28 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
METAP1DQ6UB28 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
METAP1DQ6UB28 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
METAP1DQ6UB28 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
METAP1DQ6UB28 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
METAP1DQ6UB28 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
METAP1DQ6UB28 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
METAP1DQ6UB28 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
METAP1DQ6UB28 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
METAP1DQ6UB28 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
METAP1DQ6UB28 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
METAP1DQ6UB28 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
METAP1DQ6UB28 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
METAP1DQ6UB28 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
METAP1DQ6UB28 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
METAP1DQ6UB28 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms