Protein–RNA interactions for Protein: Q6QAJ8

TMEM220, Transmembrane protein 220, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM220Q6QAJ8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM220Q6QAJ8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM220Q6QAJ8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM220Q6QAJ8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM220Q6QAJ8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM220Q6QAJ8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM220Q6QAJ8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM220Q6QAJ8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM220Q6QAJ8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM220Q6QAJ8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM220Q6QAJ8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM220Q6QAJ8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM220Q6QAJ8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM220Q6QAJ8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM220Q6QAJ8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM220Q6QAJ8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM220Q6QAJ8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM220Q6QAJ8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM220Q6QAJ8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM220Q6QAJ8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM220Q6QAJ8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM220Q6QAJ8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM220Q6QAJ8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM220Q6QAJ8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM220Q6QAJ8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM220Q6QAJ8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM220Q6QAJ8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM220Q6QAJ8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM220Q6QAJ8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM220Q6QAJ8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM220Q6QAJ8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM220Q6QAJ8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM220Q6QAJ8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM220Q6QAJ8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM220Q6QAJ8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM220Q6QAJ8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM220Q6QAJ8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM220Q6QAJ8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM220Q6QAJ8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM220Q6QAJ8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM220Q6QAJ8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM220Q6QAJ8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM220Q6QAJ8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM220Q6QAJ8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM220Q6QAJ8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM220Q6QAJ8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM220Q6QAJ8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM220Q6QAJ8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM220Q6QAJ8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM220Q6QAJ8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM220Q6QAJ8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM220Q6QAJ8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM220Q6QAJ8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM220Q6QAJ8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM220Q6QAJ8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM220Q6QAJ8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM220Q6QAJ8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM220Q6QAJ8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM220Q6QAJ8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM220Q6QAJ8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM220Q6QAJ8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM220Q6QAJ8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM220Q6QAJ8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM220Q6QAJ8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM220Q6QAJ8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM220Q6QAJ8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM220Q6QAJ8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM220Q6QAJ8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM220Q6QAJ8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM220Q6QAJ8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM220Q6QAJ8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM220Q6QAJ8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM220Q6QAJ8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM220Q6QAJ8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM220Q6QAJ8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM220Q6QAJ8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM220Q6QAJ8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM220Q6QAJ8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM220Q6QAJ8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM220Q6QAJ8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM220Q6QAJ8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM220Q6QAJ8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM220Q6QAJ8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM220Q6QAJ8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM220Q6QAJ8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM220Q6QAJ8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM220Q6QAJ8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM220Q6QAJ8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM220Q6QAJ8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM220Q6QAJ8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM220Q6QAJ8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM220Q6QAJ8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM220Q6QAJ8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM220Q6QAJ8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM220Q6QAJ8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM220Q6QAJ8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM220Q6QAJ8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM220Q6QAJ8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM220Q6QAJ8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM220Q6QAJ8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms