Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1K2

PMF1, Polyamine-modulated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMF1Q6P1K2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PMF1Q6P1K2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PMF1Q6P1K2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PMF1Q6P1K2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PMF1Q6P1K2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PMF1Q6P1K2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PMF1Q6P1K2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PMF1Q6P1K2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PMF1Q6P1K2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PMF1Q6P1K2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PMF1Q6P1K2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PMF1Q6P1K2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PMF1Q6P1K2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PMF1Q6P1K2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PMF1Q6P1K2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PMF1Q6P1K2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PMF1Q6P1K2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PMF1Q6P1K2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PMF1Q6P1K2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PMF1Q6P1K2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PMF1Q6P1K2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PMF1Q6P1K2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PMF1Q6P1K2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PMF1Q6P1K2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PMF1Q6P1K2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PMF1Q6P1K2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PMF1Q6P1K2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PMF1Q6P1K2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PMF1Q6P1K2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PMF1Q6P1K2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PMF1Q6P1K2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PMF1Q6P1K2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PMF1Q6P1K2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PMF1Q6P1K2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PMF1Q6P1K2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PMF1Q6P1K2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PMF1Q6P1K2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PMF1Q6P1K2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PMF1Q6P1K2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PMF1Q6P1K2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PMF1Q6P1K2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PMF1Q6P1K2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PMF1Q6P1K2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PMF1Q6P1K2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PMF1Q6P1K2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PMF1Q6P1K2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PMF1Q6P1K2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PMF1Q6P1K2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PMF1Q6P1K2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PMF1Q6P1K2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PMF1Q6P1K2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PMF1Q6P1K2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PMF1Q6P1K2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PMF1Q6P1K2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PMF1Q6P1K2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PMF1Q6P1K2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PMF1Q6P1K2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PMF1Q6P1K2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PMF1Q6P1K2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PMF1Q6P1K2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PMF1Q6P1K2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PMF1Q6P1K2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PMF1Q6P1K2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PMF1Q6P1K2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PMF1Q6P1K2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PMF1Q6P1K2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PMF1Q6P1K2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PMF1Q6P1K2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PMF1Q6P1K2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PMF1Q6P1K2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PMF1Q6P1K2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PMF1Q6P1K2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PMF1Q6P1K2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PMF1Q6P1K2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PMF1Q6P1K2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PMF1Q6P1K2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PMF1Q6P1K2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PMF1Q6P1K2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PMF1Q6P1K2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PMF1Q6P1K2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PMF1Q6P1K2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PMF1Q6P1K2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PMF1Q6P1K2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PMF1Q6P1K2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PMF1Q6P1K2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PMF1Q6P1K2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PMF1Q6P1K2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PMF1Q6P1K2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PMF1Q6P1K2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PMF1Q6P1K2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PMF1Q6P1K2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PMF1Q6P1K2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PMF1Q6P1K2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PMF1Q6P1K2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PMF1Q6P1K2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PMF1Q6P1K2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PMF1Q6P1K2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PMF1Q6P1K2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PMF1Q6P1K2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PMF1Q6P1K2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms