Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RSBN1Q5VWQ0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RSBN1Q5VWQ0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RSBN1Q5VWQ0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RSBN1Q5VWQ0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RSBN1Q5VWQ0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RSBN1Q5VWQ0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RSBN1Q5VWQ0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RSBN1Q5VWQ0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RSBN1Q5VWQ0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RSBN1Q5VWQ0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RSBN1Q5VWQ0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RSBN1Q5VWQ0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RSBN1Q5VWQ0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RSBN1Q5VWQ0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RSBN1Q5VWQ0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RSBN1Q5VWQ0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RSBN1Q5VWQ0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RSBN1Q5VWQ0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RSBN1Q5VWQ0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RSBN1Q5VWQ0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RSBN1Q5VWQ0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RSBN1Q5VWQ0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSBN1Q5VWQ0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSBN1Q5VWQ0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSBN1Q5VWQ0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSBN1Q5VWQ0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSBN1Q5VWQ0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSBN1Q5VWQ0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSBN1Q5VWQ0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSBN1Q5VWQ0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RSBN1Q5VWQ0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RSBN1Q5VWQ0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RSBN1Q5VWQ0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RSBN1Q5VWQ0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RSBN1Q5VWQ0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RSBN1Q5VWQ0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RSBN1Q5VWQ0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RSBN1Q5VWQ0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RSBN1Q5VWQ0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RSBN1Q5VWQ0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RSBN1Q5VWQ0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RSBN1Q5VWQ0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RSBN1Q5VWQ0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RSBN1Q5VWQ0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RSBN1Q5VWQ0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RSBN1Q5VWQ0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RSBN1Q5VWQ0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RSBN1Q5VWQ0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RSBN1Q5VWQ0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RSBN1Q5VWQ0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RSBN1Q5VWQ0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RSBN1Q5VWQ0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RSBN1Q5VWQ0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RSBN1Q5VWQ0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RSBN1Q5VWQ0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RSBN1Q5VWQ0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RSBN1Q5VWQ0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RSBN1Q5VWQ0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RSBN1Q5VWQ0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RSBN1Q5VWQ0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RSBN1Q5VWQ0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RSBN1Q5VWQ0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RSBN1Q5VWQ0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RSBN1Q5VWQ0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RSBN1Q5VWQ0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RSBN1Q5VWQ0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RSBN1Q5VWQ0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RSBN1Q5VWQ0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RSBN1Q5VWQ0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RSBN1Q5VWQ0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RSBN1Q5VWQ0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RSBN1Q5VWQ0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RSBN1Q5VWQ0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RSBN1Q5VWQ0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RSBN1Q5VWQ0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RSBN1Q5VWQ0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RSBN1Q5VWQ0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RSBN1Q5VWQ0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RSBN1Q5VWQ0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RSBN1Q5VWQ0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RSBN1Q5VWQ0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RSBN1Q5VWQ0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RSBN1Q5VWQ0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RSBN1Q5VWQ0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RSBN1Q5VWQ0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RSBN1Q5VWQ0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RSBN1Q5VWQ0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RSBN1Q5VWQ0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RSBN1Q5VWQ0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RSBN1Q5VWQ0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RSBN1Q5VWQ0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RSBN1Q5VWQ0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RSBN1Q5VWQ0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RSBN1Q5VWQ0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RSBN1Q5VWQ0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RSBN1Q5VWQ0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RSBN1Q5VWQ0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RSBN1Q5VWQ0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RSBN1Q5VWQ0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 208.6 ms