Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01545Q5VT33 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01545Q5VT33 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01545Q5VT33 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01545Q5VT33 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01545Q5VT33 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01545Q5VT33 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01545Q5VT33 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01545Q5VT33 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01545Q5VT33 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01545Q5VT33 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01545Q5VT33 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01545Q5VT33 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01545Q5VT33 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01545Q5VT33 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01545Q5VT33 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01545Q5VT33 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01545Q5VT33 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01545Q5VT33 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01545Q5VT33 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01545Q5VT33 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC01545Q5VT33 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC01545Q5VT33 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC01545Q5VT33 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC01545Q5VT33 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC01545Q5VT33 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC01545Q5VT33 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC01545Q5VT33 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC01545Q5VT33 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC01545Q5VT33 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC01545Q5VT33 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC01545Q5VT33 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC01545Q5VT33 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC01545Q5VT33 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC01545Q5VT33 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01545Q5VT33 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01545Q5VT33 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01545Q5VT33 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01545Q5VT33 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01545Q5VT33 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01545Q5VT33 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC01545Q5VT33 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC01545Q5VT33 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC01545Q5VT33 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC01545Q5VT33 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms