Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGU0

TSPO2, Translocator protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPO2Q5TGU0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPO2Q5TGU0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TSPO2Q5TGU0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TSPO2Q5TGU0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPO2Q5TGU0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TSPO2Q5TGU0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPO2Q5TGU0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPO2Q5TGU0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TSPO2Q5TGU0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TSPO2Q5TGU0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPO2Q5TGU0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPO2Q5TGU0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPO2Q5TGU0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPO2Q5TGU0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPO2Q5TGU0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPO2Q5TGU0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPO2Q5TGU0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPO2Q5TGU0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TSPO2Q5TGU0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TSPO2Q5TGU0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPO2Q5TGU0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TSPO2Q5TGU0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TSPO2Q5TGU0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSPO2Q5TGU0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TSPO2Q5TGU0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSPO2Q5TGU0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSPO2Q5TGU0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSPO2Q5TGU0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TSPO2Q5TGU0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TSPO2Q5TGU0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TSPO2Q5TGU0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TSPO2Q5TGU0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TSPO2Q5TGU0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPO2Q5TGU0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPO2Q5TGU0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPO2Q5TGU0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPO2Q5TGU0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPO2Q5TGU0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPO2Q5TGU0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPO2Q5TGU0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPO2Q5TGU0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPO2Q5TGU0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPO2Q5TGU0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPO2Q5TGU0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPO2Q5TGU0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPO2Q5TGU0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPO2Q5TGU0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPO2Q5TGU0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPO2Q5TGU0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPO2Q5TGU0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPO2Q5TGU0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPO2Q5TGU0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPO2Q5TGU0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPO2Q5TGU0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPO2Q5TGU0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPO2Q5TGU0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPO2Q5TGU0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPO2Q5TGU0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPO2Q5TGU0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPO2Q5TGU0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPO2Q5TGU0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPO2Q5TGU0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPO2Q5TGU0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPO2Q5TGU0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPO2Q5TGU0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPO2Q5TGU0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPO2Q5TGU0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPO2Q5TGU0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPO2Q5TGU0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPO2Q5TGU0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPO2Q5TGU0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPO2Q5TGU0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPO2Q5TGU0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPO2Q5TGU0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPO2Q5TGU0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPO2Q5TGU0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPO2Q5TGU0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPO2Q5TGU0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPO2Q5TGU0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPO2Q5TGU0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPO2Q5TGU0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPO2Q5TGU0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPO2Q5TGU0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPO2Q5TGU0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPO2Q5TGU0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPO2Q5TGU0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPO2Q5TGU0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPO2Q5TGU0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPO2Q5TGU0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPO2Q5TGU0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPO2Q5TGU0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPO2Q5TGU0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPO2Q5TGU0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPO2Q5TGU0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPO2Q5TGU0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPO2Q5TGU0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPO2Q5TGU0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSPO2Q5TGU0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSPO2Q5TGU0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSPO2Q5TGU0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 202.3 ms