Protein–RNA interactions for Protein: Q5C9Z4

NOM1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1Q5C9Z4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NOM1Q5C9Z4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NOM1Q5C9Z4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NOM1Q5C9Z4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NOM1Q5C9Z4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NOM1Q5C9Z4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NOM1Q5C9Z4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NOM1Q5C9Z4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NOM1Q5C9Z4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NOM1Q5C9Z4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NOM1Q5C9Z4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NOM1Q5C9Z4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NOM1Q5C9Z4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NOM1Q5C9Z4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NOM1Q5C9Z4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NOM1Q5C9Z4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NOM1Q5C9Z4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NOM1Q5C9Z4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NOM1Q5C9Z4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NOM1Q5C9Z4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NOM1Q5C9Z4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NOM1Q5C9Z4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NOM1Q5C9Z4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NOM1Q5C9Z4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NOM1Q5C9Z4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NOM1Q5C9Z4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NOM1Q5C9Z4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NOM1Q5C9Z4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NOM1Q5C9Z4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NOM1Q5C9Z4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NOM1Q5C9Z4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NOM1Q5C9Z4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NOM1Q5C9Z4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
NOM1Q5C9Z4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
NOM1Q5C9Z4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NOM1Q5C9Z4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NOM1Q5C9Z4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NOM1Q5C9Z4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NOM1Q5C9Z4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NOM1Q5C9Z4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NOM1Q5C9Z4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NOM1Q5C9Z4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NOM1Q5C9Z4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NOM1Q5C9Z4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NOM1Q5C9Z4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NOM1Q5C9Z4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NOM1Q5C9Z4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NOM1Q5C9Z4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NOM1Q5C9Z4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NOM1Q5C9Z4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NOM1Q5C9Z4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NOM1Q5C9Z4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NOM1Q5C9Z4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NOM1Q5C9Z4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NOM1Q5C9Z4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NOM1Q5C9Z4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NOM1Q5C9Z4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NOM1Q5C9Z4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NOM1Q5C9Z4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NOM1Q5C9Z4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NOM1Q5C9Z4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NOM1Q5C9Z4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NOM1Q5C9Z4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NOM1Q5C9Z4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NOM1Q5C9Z4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NOM1Q5C9Z4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NOM1Q5C9Z4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NOM1Q5C9Z4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NOM1Q5C9Z4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NOM1Q5C9Z4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NOM1Q5C9Z4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NOM1Q5C9Z4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NOM1Q5C9Z4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NOM1Q5C9Z4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NOM1Q5C9Z4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NOM1Q5C9Z4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NOM1Q5C9Z4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NOM1Q5C9Z4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NOM1Q5C9Z4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NOM1Q5C9Z4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NOM1Q5C9Z4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NOM1Q5C9Z4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NOM1Q5C9Z4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NOM1Q5C9Z4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NOM1Q5C9Z4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NOM1Q5C9Z4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NOM1Q5C9Z4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NOM1Q5C9Z4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NOM1Q5C9Z4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NOM1Q5C9Z4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
NOM1Q5C9Z4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
NOM1Q5C9Z4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NOM1Q5C9Z4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NOM1Q5C9Z4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
NOM1Q5C9Z4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NOM1Q5C9Z4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NOM1Q5C9Z4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
NOM1Q5C9Z4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NOM1Q5C9Z4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NOM1Q5C9Z4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms