Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC38Q502W7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC38Q502W7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC38Q502W7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC38Q502W7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC38Q502W7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC38Q502W7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC38Q502W7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC38Q502W7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC38Q502W7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC38Q502W7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC38Q502W7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC38Q502W7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC38Q502W7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC38Q502W7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC38Q502W7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC38Q502W7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC38Q502W7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC38Q502W7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC38Q502W7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC38Q502W7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC38Q502W7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC38Q502W7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC38Q502W7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC38Q502W7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC38Q502W7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC38Q502W7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC38Q502W7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC38Q502W7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC38Q502W7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC38Q502W7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC38Q502W7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC38Q502W7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC38Q502W7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC38Q502W7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC38Q502W7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC38Q502W7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC38Q502W7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC38Q502W7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC38Q502W7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC38Q502W7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC38Q502W7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC38Q502W7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC38Q502W7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC38Q502W7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC38Q502W7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC38Q502W7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC38Q502W7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC38Q502W7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC38Q502W7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC38Q502W7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC38Q502W7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC38Q502W7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC38Q502W7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC38Q502W7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC38Q502W7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC38Q502W7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC38Q502W7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC38Q502W7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC38Q502W7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC38Q502W7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC38Q502W7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC38Q502W7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC38Q502W7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC38Q502W7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC38Q502W7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC38Q502W7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC38Q502W7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC38Q502W7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC38Q502W7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC38Q502W7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC38Q502W7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC38Q502W7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC38Q502W7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC38Q502W7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC38Q502W7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC38Q502W7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC38Q502W7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC38Q502W7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC38Q502W7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC38Q502W7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC38Q502W7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC38Q502W7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC38Q502W7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC38Q502W7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC38Q502W7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC38Q502W7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC38Q502W7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC38Q502W7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC38Q502W7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC38Q502W7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC38Q502W7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC38Q502W7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC38Q502W7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC38Q502W7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC38Q502W7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC38Q502W7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC38Q502W7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC38Q502W7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC38Q502W7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms