Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SVEP1Q4LDE5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SVEP1Q4LDE5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SVEP1Q4LDE5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SVEP1Q4LDE5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SVEP1Q4LDE5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SVEP1Q4LDE5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SVEP1Q4LDE5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SVEP1Q4LDE5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SVEP1Q4LDE5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SVEP1Q4LDE5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SVEP1Q4LDE5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SVEP1Q4LDE5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SVEP1Q4LDE5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SVEP1Q4LDE5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SVEP1Q4LDE5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SVEP1Q4LDE5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SVEP1Q4LDE5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SVEP1Q4LDE5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SVEP1Q4LDE5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SVEP1Q4LDE5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SVEP1Q4LDE5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SVEP1Q4LDE5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SVEP1Q4LDE5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SVEP1Q4LDE5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SVEP1Q4LDE5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SVEP1Q4LDE5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SVEP1Q4LDE5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SVEP1Q4LDE5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SVEP1Q4LDE5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SVEP1Q4LDE5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SVEP1Q4LDE5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SVEP1Q4LDE5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SVEP1Q4LDE5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SVEP1Q4LDE5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SVEP1Q4LDE5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SVEP1Q4LDE5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SVEP1Q4LDE5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SVEP1Q4LDE5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SVEP1Q4LDE5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SVEP1Q4LDE5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SVEP1Q4LDE5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SVEP1Q4LDE5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SVEP1Q4LDE5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SVEP1Q4LDE5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SVEP1Q4LDE5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SVEP1Q4LDE5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SVEP1Q4LDE5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SVEP1Q4LDE5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SVEP1Q4LDE5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SVEP1Q4LDE5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SVEP1Q4LDE5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
SVEP1Q4LDE5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SVEP1Q4LDE5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SVEP1Q4LDE5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SVEP1Q4LDE5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SVEP1Q4LDE5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SVEP1Q4LDE5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SVEP1Q4LDE5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SVEP1Q4LDE5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SVEP1Q4LDE5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SVEP1Q4LDE5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SVEP1Q4LDE5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SVEP1Q4LDE5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SVEP1Q4LDE5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SVEP1Q4LDE5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SVEP1Q4LDE5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SVEP1Q4LDE5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SVEP1Q4LDE5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SVEP1Q4LDE5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SVEP1Q4LDE5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SVEP1Q4LDE5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SVEP1Q4LDE5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SVEP1Q4LDE5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SVEP1Q4LDE5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SVEP1Q4LDE5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SVEP1Q4LDE5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SVEP1Q4LDE5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SVEP1Q4LDE5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SVEP1Q4LDE5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SVEP1Q4LDE5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SVEP1Q4LDE5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SVEP1Q4LDE5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SVEP1Q4LDE5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SVEP1Q4LDE5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SVEP1Q4LDE5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SVEP1Q4LDE5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SVEP1Q4LDE5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SVEP1Q4LDE5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SVEP1Q4LDE5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SVEP1Q4LDE5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SVEP1Q4LDE5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SVEP1Q4LDE5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SVEP1Q4LDE5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SVEP1Q4LDE5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SVEP1Q4LDE5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SVEP1Q4LDE5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SVEP1Q4LDE5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SVEP1Q4LDE5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SVEP1Q4LDE5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1061.1 ms