Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PROX2Q3B8N5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PROX2Q3B8N5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PROX2Q3B8N5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PROX2Q3B8N5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PROX2Q3B8N5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PROX2Q3B8N5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PROX2Q3B8N5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PROX2Q3B8N5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PROX2Q3B8N5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PROX2Q3B8N5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PROX2Q3B8N5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PROX2Q3B8N5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PROX2Q3B8N5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PROX2Q3B8N5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PROX2Q3B8N5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PROX2Q3B8N5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PROX2Q3B8N5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PROX2Q3B8N5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PROX2Q3B8N5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PROX2Q3B8N5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PROX2Q3B8N5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PROX2Q3B8N5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PROX2Q3B8N5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PROX2Q3B8N5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PROX2Q3B8N5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PROX2Q3B8N5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PROX2Q3B8N5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PROX2Q3B8N5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PROX2Q3B8N5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PROX2Q3B8N5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PROX2Q3B8N5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PROX2Q3B8N5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PROX2Q3B8N5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PROX2Q3B8N5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PROX2Q3B8N5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PROX2Q3B8N5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PROX2Q3B8N5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PROX2Q3B8N5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PROX2Q3B8N5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PROX2Q3B8N5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PROX2Q3B8N5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PROX2Q3B8N5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PROX2Q3B8N5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PROX2Q3B8N5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PROX2Q3B8N5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PROX2Q3B8N5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PROX2Q3B8N5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PROX2Q3B8N5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PROX2Q3B8N5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PROX2Q3B8N5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PROX2Q3B8N5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PROX2Q3B8N5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PROX2Q3B8N5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PROX2Q3B8N5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PROX2Q3B8N5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PROX2Q3B8N5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PROX2Q3B8N5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PROX2Q3B8N5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PROX2Q3B8N5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PROX2Q3B8N5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PROX2Q3B8N5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PROX2Q3B8N5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PROX2Q3B8N5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PROX2Q3B8N5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PROX2Q3B8N5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PROX2Q3B8N5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PROX2Q3B8N5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PROX2Q3B8N5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PROX2Q3B8N5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PROX2Q3B8N5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PROX2Q3B8N5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PROX2Q3B8N5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PROX2Q3B8N5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PROX2Q3B8N5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PROX2Q3B8N5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PROX2Q3B8N5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PROX2Q3B8N5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PROX2Q3B8N5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PROX2Q3B8N5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PROX2Q3B8N5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PROX2Q3B8N5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PROX2Q3B8N5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PROX2Q3B8N5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PROX2Q3B8N5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PROX2Q3B8N5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PROX2Q3B8N5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PROX2Q3B8N5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PROX2Q3B8N5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PROX2Q3B8N5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PROX2Q3B8N5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PROX2Q3B8N5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PROX2Q3B8N5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PROX2Q3B8N5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PROX2Q3B8N5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PROX2Q3B8N5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PROX2Q3B8N5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PROX2Q3B8N5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PROX2Q3B8N5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PROX2Q3B8N5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms