Protein–RNA interactions for Protein: Q2WEN9

CEACAM16, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 16, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM16Q2WEN9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEACAM16Q2WEN9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEACAM16Q2WEN9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEACAM16Q2WEN9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEACAM16Q2WEN9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEACAM16Q2WEN9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEACAM16Q2WEN9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEACAM16Q2WEN9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEACAM16Q2WEN9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CEACAM16Q2WEN9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CEACAM16Q2WEN9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CEACAM16Q2WEN9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEACAM16Q2WEN9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEACAM16Q2WEN9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEACAM16Q2WEN9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEACAM16Q2WEN9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEACAM16Q2WEN9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEACAM16Q2WEN9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEACAM16Q2WEN9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEACAM16Q2WEN9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEACAM16Q2WEN9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEACAM16Q2WEN9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEACAM16Q2WEN9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEACAM16Q2WEN9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEACAM16Q2WEN9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEACAM16Q2WEN9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEACAM16Q2WEN9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEACAM16Q2WEN9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEACAM16Q2WEN9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEACAM16Q2WEN9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEACAM16Q2WEN9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEACAM16Q2WEN9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEACAM16Q2WEN9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEACAM16Q2WEN9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CEACAM16Q2WEN9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEACAM16Q2WEN9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEACAM16Q2WEN9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEACAM16Q2WEN9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEACAM16Q2WEN9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEACAM16Q2WEN9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEACAM16Q2WEN9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEACAM16Q2WEN9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEACAM16Q2WEN9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEACAM16Q2WEN9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEACAM16Q2WEN9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEACAM16Q2WEN9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEACAM16Q2WEN9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEACAM16Q2WEN9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEACAM16Q2WEN9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CEACAM16Q2WEN9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEACAM16Q2WEN9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CEACAM16Q2WEN9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEACAM16Q2WEN9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CEACAM16Q2WEN9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CEACAM16Q2WEN9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CEACAM16Q2WEN9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CEACAM16Q2WEN9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CEACAM16Q2WEN9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CEACAM16Q2WEN9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CEACAM16Q2WEN9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEACAM16Q2WEN9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEACAM16Q2WEN9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEACAM16Q2WEN9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEACAM16Q2WEN9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CEACAM16Q2WEN9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CEACAM16Q2WEN9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEACAM16Q2WEN9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEACAM16Q2WEN9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEACAM16Q2WEN9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEACAM16Q2WEN9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEACAM16Q2WEN9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEACAM16Q2WEN9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEACAM16Q2WEN9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEACAM16Q2WEN9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEACAM16Q2WEN9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEACAM16Q2WEN9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEACAM16Q2WEN9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEACAM16Q2WEN9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEACAM16Q2WEN9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEACAM16Q2WEN9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEACAM16Q2WEN9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEACAM16Q2WEN9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEACAM16Q2WEN9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CEACAM16Q2WEN9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEACAM16Q2WEN9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEACAM16Q2WEN9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEACAM16Q2WEN9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEACAM16Q2WEN9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CEACAM16Q2WEN9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEACAM16Q2WEN9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEACAM16Q2WEN9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEACAM16Q2WEN9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CEACAM16Q2WEN9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CEACAM16Q2WEN9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CEACAM16Q2WEN9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CEACAM16Q2WEN9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CEACAM16Q2WEN9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CEACAM16Q2WEN9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CEACAM16Q2WEN9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CEACAM16Q2WEN9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms