Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GEN1Q17RS7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GEN1Q17RS7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GEN1Q17RS7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GEN1Q17RS7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GEN1Q17RS7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GEN1Q17RS7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GEN1Q17RS7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GEN1Q17RS7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GEN1Q17RS7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GEN1Q17RS7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GEN1Q17RS7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GEN1Q17RS7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GEN1Q17RS7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GEN1Q17RS7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GEN1Q17RS7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GEN1Q17RS7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GEN1Q17RS7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GEN1Q17RS7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GEN1Q17RS7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GEN1Q17RS7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GEN1Q17RS7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GEN1Q17RS7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GEN1Q17RS7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GEN1Q17RS7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GEN1Q17RS7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GEN1Q17RS7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GEN1Q17RS7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GEN1Q17RS7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GEN1Q17RS7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GEN1Q17RS7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GEN1Q17RS7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GEN1Q17RS7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GEN1Q17RS7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GEN1Q17RS7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GEN1Q17RS7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GEN1Q17RS7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GEN1Q17RS7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GEN1Q17RS7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GEN1Q17RS7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GEN1Q17RS7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GEN1Q17RS7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GEN1Q17RS7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GEN1Q17RS7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GEN1Q17RS7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GEN1Q17RS7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GEN1Q17RS7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GEN1Q17RS7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GEN1Q17RS7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GEN1Q17RS7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GEN1Q17RS7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GEN1Q17RS7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GEN1Q17RS7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GEN1Q17RS7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GEN1Q17RS7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GEN1Q17RS7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GEN1Q17RS7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GEN1Q17RS7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GEN1Q17RS7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GEN1Q17RS7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GEN1Q17RS7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GEN1Q17RS7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GEN1Q17RS7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GEN1Q17RS7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GEN1Q17RS7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GEN1Q17RS7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GEN1Q17RS7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GEN1Q17RS7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GEN1Q17RS7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GEN1Q17RS7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GEN1Q17RS7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GEN1Q17RS7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GEN1Q17RS7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GEN1Q17RS7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GEN1Q17RS7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GEN1Q17RS7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GEN1Q17RS7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GEN1Q17RS7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GEN1Q17RS7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GEN1Q17RS7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GEN1Q17RS7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GEN1Q17RS7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GEN1Q17RS7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GEN1Q17RS7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GEN1Q17RS7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GEN1Q17RS7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GEN1Q17RS7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GEN1Q17RS7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GEN1Q17RS7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GEN1Q17RS7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GEN1Q17RS7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GEN1Q17RS7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GEN1Q17RS7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GEN1Q17RS7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GEN1Q17RS7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GEN1Q17RS7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GEN1Q17RS7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GEN1Q17RS7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GEN1Q17RS7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GEN1Q17RS7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
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