Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZIC1Q15915 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZIC1Q15915 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZIC1Q15915 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZIC1Q15915 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZIC1Q15915 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZIC1Q15915 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZIC1Q15915 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ZIC1Q15915 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZIC1Q15915 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZIC1Q15915 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZIC1Q15915 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZIC1Q15915 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZIC1Q15915 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZIC1Q15915 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZIC1Q15915 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZIC1Q15915 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZIC1Q15915 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZIC1Q15915 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZIC1Q15915 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZIC1Q15915 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZIC1Q15915 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZIC1Q15915 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZIC1Q15915 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZIC1Q15915 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZIC1Q15915 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZIC1Q15915 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZIC1Q15915 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZIC1Q15915 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZIC1Q15915 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZIC1Q15915 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZIC1Q15915 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZIC1Q15915 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZIC1Q15915 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZIC1Q15915 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZIC1Q15915 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZIC1Q15915 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZIC1Q15915 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZIC1Q15915 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZIC1Q15915 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZIC1Q15915 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZIC1Q15915 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZIC1Q15915 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZIC1Q15915 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZIC1Q15915 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ZIC1Q15915 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZIC1Q15915 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZIC1Q15915 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZIC1Q15915 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZIC1Q15915 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZIC1Q15915 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZIC1Q15915 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZIC1Q15915 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZIC1Q15915 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZIC1Q15915 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ZIC1Q15915 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZIC1Q15915 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZIC1Q15915 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ZIC1Q15915 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZIC1Q15915 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZIC1Q15915 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ZIC1Q15915 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZIC1Q15915 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZIC1Q15915 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZIC1Q15915 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZIC1Q15915 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZIC1Q15915 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZIC1Q15915 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZIC1Q15915 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZIC1Q15915 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZIC1Q15915 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZIC1Q15915 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZIC1Q15915 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZIC1Q15915 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZIC1Q15915 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZIC1Q15915 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZIC1Q15915 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZIC1Q15915 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZIC1Q15915 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZIC1Q15915 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ZIC1Q15915 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ZIC1Q15915 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ZIC1Q15915 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZIC1Q15915 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZIC1Q15915 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZIC1Q15915 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZIC1Q15915 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZIC1Q15915 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZIC1Q15915 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZIC1Q15915 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZIC1Q15915 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZIC1Q15915 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZIC1Q15915 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZIC1Q15915 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZIC1Q15915 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZIC1Q15915 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZIC1Q15915 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZIC1Q15915 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZIC1Q15915 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZIC1Q15915 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms