Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SS18Q15532 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SS18Q15532 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SS18Q15532 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SS18Q15532 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SS18Q15532 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SS18Q15532 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SS18Q15532 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SS18Q15532 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SS18Q15532 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SS18Q15532 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SS18Q15532 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SS18Q15532 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SS18Q15532 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SS18Q15532 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SS18Q15532 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SS18Q15532 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SS18Q15532 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SS18Q15532 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SS18Q15532 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SS18Q15532 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SS18Q15532 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SS18Q15532 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SS18Q15532 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SS18Q15532 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SS18Q15532 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SS18Q15532 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SS18Q15532 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18Q15532 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18Q15532 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18Q15532 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18Q15532 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18Q15532 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18Q15532 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18Q15532 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18Q15532 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18Q15532 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18Q15532 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18Q15532 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18Q15532 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18Q15532 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18Q15532 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SS18Q15532 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SS18Q15532 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SS18Q15532 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SS18Q15532 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SS18Q15532 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SS18Q15532 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SS18Q15532 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SS18Q15532 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SS18Q15532 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SS18Q15532 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SS18Q15532 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SS18Q15532 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SS18Q15532 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SS18Q15532 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SS18Q15532 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SS18Q15532 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SS18Q15532 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SS18Q15532 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SS18Q15532 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SS18Q15532 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SS18Q15532 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SS18Q15532 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SS18Q15532 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SS18Q15532 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SS18Q15532 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SS18Q15532 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SS18Q15532 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SS18Q15532 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SS18Q15532 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SS18Q15532 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SS18Q15532 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SS18Q15532 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SS18Q15532 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SS18Q15532 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SS18Q15532 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SS18Q15532 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SS18Q15532 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SS18Q15532 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SS18Q15532 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SS18Q15532 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SS18Q15532 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SS18Q15532 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SS18Q15532 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SS18Q15532 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SS18Q15532 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SS18Q15532 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SS18Q15532 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SS18Q15532 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SS18Q15532 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SS18Q15532 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SS18Q15532 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SS18Q15532 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SS18Q15532 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SS18Q15532 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SS18Q15532 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SS18Q15532 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SS18Q15532 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SS18Q15532 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms