Protein–RNA interactions for Protein: Q13477

MADCAM1, Mucosal addressin cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MADCAM1Q13477 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MADCAM1Q13477 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MADCAM1Q13477 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MADCAM1Q13477 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MADCAM1Q13477 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MADCAM1Q13477 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MADCAM1Q13477 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MADCAM1Q13477 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MADCAM1Q13477 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MADCAM1Q13477 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MADCAM1Q13477 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MADCAM1Q13477 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MADCAM1Q13477 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MADCAM1Q13477 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MADCAM1Q13477 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MADCAM1Q13477 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MADCAM1Q13477 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MADCAM1Q13477 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MADCAM1Q13477 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MADCAM1Q13477 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MADCAM1Q13477 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MADCAM1Q13477 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MADCAM1Q13477 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MADCAM1Q13477 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MADCAM1Q13477 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MADCAM1Q13477 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MADCAM1Q13477 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MADCAM1Q13477 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MADCAM1Q13477 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MADCAM1Q13477 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MADCAM1Q13477 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MADCAM1Q13477 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MADCAM1Q13477 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MADCAM1Q13477 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MADCAM1Q13477 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MADCAM1Q13477 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MADCAM1Q13477 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MADCAM1Q13477 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MADCAM1Q13477 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MADCAM1Q13477 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MADCAM1Q13477 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MADCAM1Q13477 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MADCAM1Q13477 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MADCAM1Q13477 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MADCAM1Q13477 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MADCAM1Q13477 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MADCAM1Q13477 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MADCAM1Q13477 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MADCAM1Q13477 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MADCAM1Q13477 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MADCAM1Q13477 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MADCAM1Q13477 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MADCAM1Q13477 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MADCAM1Q13477 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
MADCAM1Q13477 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MADCAM1Q13477 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MADCAM1Q13477 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MADCAM1Q13477 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MADCAM1Q13477 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MADCAM1Q13477 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MADCAM1Q13477 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MADCAM1Q13477 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MADCAM1Q13477 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
MADCAM1Q13477 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MADCAM1Q13477 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MADCAM1Q13477 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MADCAM1Q13477 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MADCAM1Q13477 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MADCAM1Q13477 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MADCAM1Q13477 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MADCAM1Q13477 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MADCAM1Q13477 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MADCAM1Q13477 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MADCAM1Q13477 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MADCAM1Q13477 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MADCAM1Q13477 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MADCAM1Q13477 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MADCAM1Q13477 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MADCAM1Q13477 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MADCAM1Q13477 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MADCAM1Q13477 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MADCAM1Q13477 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MADCAM1Q13477 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MADCAM1Q13477 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MADCAM1Q13477 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MADCAM1Q13477 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MADCAM1Q13477 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MADCAM1Q13477 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MADCAM1Q13477 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MADCAM1Q13477 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MADCAM1Q13477 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
MADCAM1Q13477 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MADCAM1Q13477 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MADCAM1Q13477 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MADCAM1Q13477 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MADCAM1Q13477 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MADCAM1Q13477 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MADCAM1Q13477 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MADCAM1Q13477 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MADCAM1Q13477 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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