Protein–RNA interactions for Protein: Q12330

SME1, Small nuclear ribonucleoprotein E, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SME1Q12330 ASR1YPR093C 867 nt5.13□□□□□ -1.59
SME1Q12330 SEC18YBR080C 2277 nt5.13□□□□□ -1.59
SME1Q12330 VMA3YEL027W 483 nt5.12□□□□□ -1.59
SME1Q12330 YNL108CYNL108C 813 nt5.12□□□□□ -1.59
SME1Q12330 GLN1YPR035W 1113 nt5.12□□□□□ -1.59
SME1Q12330 NHP6BYBR089C-A 300 nt5.12□□□□□ -1.59
SME1Q12330 HXK2YGL253W 1461 nt5.12□□□□□ -1.59
SME1Q12330 HRQ1YDR291W 3234 nt5.12□□□□□ -1.59
SME1Q12330 UTP9YHR196W 1728 nt5.11□□□□□ -1.59
SME1Q12330 VPS72YDR485C 2388 nt5.11□□□□□ -1.59
SME1Q12330 CYS3YAL012W 1185 nt5.11□□□□□ -1.59
SME1Q12330 RPE1YJL121C 717 nt5.11□□□□□ -1.59
SME1Q12330 CLB1YGR108W 1416 nt5.11□□□□□ -1.59
SME1Q12330 PPH21YDL134C 1110 nt5.1□□□□□ -1.59
SME1Q12330 EXG1YLR300W 1347 nt5.1□□□□□ -1.59
SME1Q12330 SML1YML058W 315 nt5.1□□□□□ -1.59
SME1Q12330 YMR155WYMR155W 1644 nt5.1□□□□□ -1.59
SME1Q12330 YOL046CYOL046C 675 nt5.1□□□□□ -1.59
SME1Q12330 LDB19YOR322C 2457 nt5.1□□□□□ -1.59
SME1Q12330 VMA4YOR332W 702 nt5.1□□□□□ -1.59
SME1Q12330 HIR1YBL008W 2523 nt5.09□□□□□ -1.59
SME1Q12330 ARO10YDR380W 1908 nt5.09□□□□□ -1.59
SME1Q12330 PCS60YBR222C 1632 nt5.09□□□□□ -1.59
SME1Q12330 COX15YER141W 1461 nt5.09□□□□□ -1.59
SME1Q12330 HSP150YJL159W 1242 nt5.09□□□□□ -1.59
SME1Q12330 SRL2YLR082C 1179 nt5.09□□□□□ -1.59
SME1Q12330 CCT8YJL008C 1707 nt5.08□□□□□ -1.6
SME1Q12330 AVO1YOL078W 3531 nt5.07□□□□□ -1.6
SME1Q12330 DUG1YFR044C 1446 nt5.07□□□□□ -1.6
SME1Q12330 RPT3YDR394W 1287 nt5.07□□□□□ -1.6
SME1Q12330 SOD2YHR008C 702 nt5.07□□□□□ -1.6
SME1Q12330 YKL102CYKL102C 306 nt5.07□□□□□ -1.6
SME1Q12330 GTO3YMR251W 1101 nt5.07□□□□□ -1.6
SME1Q12330 MSO1YNR049C 633 nt5.07□□□□□ -1.6
SME1Q12330 YTP1YNL237W 1380 nt5.06□□□□□ -1.6
SME1Q12330 AMD2YDR242W 1650 nt5.06□□□□□ -1.6
SME1Q12330 YCK1YHR135C 1617 nt5.06□□□□□ -1.6
SME1Q12330 SUP2tY(GUA)D 75 nt5.06□□□□□ -1.6
SME1Q12330 SUP11tY(GUA)F1 75 nt5.06□□□□□ -1.6
SME1Q12330 SUP6tY(GUA)F2 75 nt5.06□□□□□ -1.6
SME1Q12330 SUP7tY(GUA)J1 75 nt5.06□□□□□ -1.6
SME1Q12330 SUP4tY(GUA)J2 75 nt5.06□□□□□ -1.6
SME1Q12330 SUP5tY(GUA)M1 75 nt5.06□□□□□ -1.6
SME1Q12330 SUP8tY(GUA)M2 75 nt5.06□□□□□ -1.6
SME1Q12330 SUP3tY(GUA)O 75 nt5.06□□□□□ -1.6
SME1Q12330 RPL10YLR075W 666 nt5.06□□□□□ -1.6
SME1Q12330 RIB1YBL033C 1038 nt5.06□□□□□ -1.6
SME1Q12330 PPT1YGR123C 1542 nt5.06□□□□□ -1.6
SME1Q12330 MSS116YDR194C 1995 nt5.05□□□□□ -1.6
SME1Q12330 YLL067CYLL067C 3618 nt5.05□□□□□ -1.6
SME1Q12330 RPN11YFR004W 921 nt5.05□□□□□ -1.6
SME1Q12330 YOL131WYOL131W 327 nt5.05□□□□□ -1.6
SME1Q12330 PTC4YBR125C 1182 nt5.05□□□□□ -1.6
SME1Q12330 GUD1YDL238C 1470 nt5.05□□□□□ -1.6
SME1Q12330 SET5YHR207C 1581 nt5.04□□□□□ -1.6
SME1Q12330 SAC6YDR129C 1929 nt5.04□□□□□ -1.6
SME1Q12330 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt5.04□□□□□ -1.6
SME1Q12330 PSR2YLR019W 1194 nt5.04□□□□□ -1.6
SME1Q12330 YML079WYML079W 606 nt5.04□□□□□ -1.6
SME1Q12330 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt5.04□□□□□ -1.6
SME1Q12330 MCH1YDL054C 1461 nt5.03□□□□□ -1.6
SME1Q12330 YNR040WYNR040W 771 nt5.03□□□□□ -1.6
SME1Q12330 TNA1YGR260W 1605 nt5.03□□□□□ -1.6
SME1Q12330 YNL247WYNL247W 2304 nt5.03□□□□□ -1.6
SME1Q12330 GPT2YKR067W 2232 nt5.03□□□□□ -1.6
SME1Q12330 GAT1YFL021W 1533 nt5.02□□□□□ -1.61
SME1Q12330 BUG1YDL099W 1026 nt5.02□□□□□ -1.61
SME1Q12330 FMO1YHR176W 1299 nt5.02□□□□□ -1.61
SME1Q12330 DOM34YNL001W 1161 nt5.02□□□□□ -1.61
SME1Q12330 RPN7YPR108W 1290 nt5.02□□□□□ -1.61
SME1Q12330 TKL1YPR074C 2043 nt5.02□□□□□ -1.61
SME1Q12330 SFB3YHR098C 2790 nt5.02□□□□□ -1.61
SME1Q12330 FRS2YFL022C 1512 nt5.02□□□□□ -1.61
SME1Q12330 NOP7YGR103W 1818 nt5.02□□□□□ -1.61
SME1Q12330 KKQ8YKL168C 2175 nt5.01□□□□□ -1.61
SME1Q12330 GUA1YMR217W 1578 nt5.01□□□□□ -1.61
SME1Q12330 CHO1YER026C 831 nt5.01□□□□□ -1.61
SME1Q12330 QNS1YHR074W 2145 nt5.01□□□□□ -1.61
SME1Q12330 BCY1YIL033C 1251 nt5.01□□□□□ -1.61
SME1Q12330 ASF1YJL115W 840 nt5.01□□□□□ -1.61
SME1Q12330 JJJ3YJR097W 519 nt5.01□□□□□ -1.61
SME1Q12330 YKL153WYKL153W 510 nt5.01□□□□□ -1.61
SME1Q12330 YKR073CYKR073C 321 nt5.01□□□□□ -1.61
SME1Q12330 COX17YLL009C 210 nt5.01□□□□□ -1.61
SME1Q12330 TAL1YLR354C 1008 nt5.01□□□□□ -1.61
SME1Q12330 FSF1YOR271C 984 nt5.01□□□□□ -1.61
SME1Q12330 PDB1YBR221C 1101 nt5.01□□□□□ -1.61
SME1Q12330 PYC1YGL062W 3537 nt5.01□□□□□ -1.61
SME1Q12330 GEX2YKR106W 1848 nt5.01□□□□□ -1.61
SME1Q12330 GPA2YER020W 1350 nt5.01□□□□□ -1.61
SME1Q12330 LSG1YGL099W 1923 nt5.01□□□□□ -1.61
SME1Q12330 MCM6YGL201C 3054 nt5□□□□□ -1.61
SME1Q12330 SUB2YDL084W 1341 nt5□□□□□ -1.61
SME1Q12330 YEL020CYEL020C 1683 nt5□□□□□ -1.61
SME1Q12330 PUP2YGR253C 783 nt5□□□□□ -1.61
SME1Q12330 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt5□□□□□ -1.61
SME1Q12330 RPS3YNL178W 723 nt5□□□□□ -1.61
SME1Q12330 CYS4YGR155W 1524 nt5□□□□□ -1.61
SME1Q12330 CRH1YGR189C 1524 nt5□□□□□ -1.61
SME1Q12330 MKK2YPL140C 1521 nt5□□□□□ -1.61
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