Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPOCK1Q08629 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPOCK1Q08629 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPOCK1Q08629 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPOCK1Q08629 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPOCK1Q08629 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPOCK1Q08629 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPOCK1Q08629 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPOCK1Q08629 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SPOCK1Q08629 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SPOCK1Q08629 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SPOCK1Q08629 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SPOCK1Q08629 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPOCK1Q08629 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPOCK1Q08629 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPOCK1Q08629 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SPOCK1Q08629 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SPOCK1Q08629 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SPOCK1Q08629 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPOCK1Q08629 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPOCK1Q08629 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPOCK1Q08629 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPOCK1Q08629 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPOCK1Q08629 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPOCK1Q08629 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SPOCK1Q08629 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPOCK1Q08629 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPOCK1Q08629 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPOCK1Q08629 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPOCK1Q08629 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPOCK1Q08629 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPOCK1Q08629 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SPOCK1Q08629 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPOCK1Q08629 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPOCK1Q08629 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SPOCK1Q08629 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPOCK1Q08629 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPOCK1Q08629 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPOCK1Q08629 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPOCK1Q08629 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPOCK1Q08629 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPOCK1Q08629 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPOCK1Q08629 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms