Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACVR1Q04771 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACVR1Q04771 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACVR1Q04771 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACVR1Q04771 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACVR1Q04771 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACVR1Q04771 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACVR1Q04771 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACVR1Q04771 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACVR1Q04771 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACVR1Q04771 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ACVR1Q04771 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACVR1Q04771 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACVR1Q04771 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACVR1Q04771 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACVR1Q04771 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACVR1Q04771 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACVR1Q04771 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACVR1Q04771 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACVR1Q04771 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACVR1Q04771 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACVR1Q04771 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACVR1Q04771 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACVR1Q04771 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACVR1Q04771 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACVR1Q04771 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACVR1Q04771 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACVR1Q04771 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACVR1Q04771 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACVR1Q04771 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACVR1Q04771 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ACVR1Q04771 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACVR1Q04771 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACVR1Q04771 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACVR1Q04771 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACVR1Q04771 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACVR1Q04771 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ACVR1Q04771 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACVR1Q04771 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ACVR1Q04771 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACVR1Q04771 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACVR1Q04771 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACVR1Q04771 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACVR1Q04771 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACVR1Q04771 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACVR1Q04771 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ACVR1Q04771 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACVR1Q04771 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ACVR1Q04771 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACVR1Q04771 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACVR1Q04771 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACVR1Q04771 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACVR1Q04771 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACVR1Q04771 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACVR1Q04771 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ACVR1Q04771 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACVR1Q04771 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACVR1Q04771 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACVR1Q04771 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACVR1Q04771 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACVR1Q04771 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACVR1Q04771 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACVR1Q04771 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACVR1Q04771 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACVR1Q04771 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACVR1Q04771 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACVR1Q04771 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACVR1Q04771 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACVR1Q04771 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACVR1Q04771 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACVR1Q04771 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACVR1Q04771 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACVR1Q04771 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACVR1Q04771 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACVR1Q04771 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACVR1Q04771 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACVR1Q04771 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACVR1Q04771 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACVR1Q04771 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ACVR1Q04771 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACVR1Q04771 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACVR1Q04771 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACVR1Q04771 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACVR1Q04771 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACVR1Q04771 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACVR1Q04771 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACVR1Q04771 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACVR1Q04771 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACVR1Q04771 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACVR1Q04771 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACVR1Q04771 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACVR1Q04771 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACVR1Q04771 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACVR1Q04771 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACVR1Q04771 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACVR1Q04771 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACVR1Q04771 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACVR1Q04771 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACVR1Q04771 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACVR1Q04771 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms