Protein–RNA interactions for Protein: Q03164

KMT2A, Histone-lysine N-methyltransferase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 3,969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KMT2AQ03164 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KMT2AQ03164 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KMT2AQ03164 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
KMT2AQ03164 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KMT2AQ03164 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KMT2AQ03164 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KMT2AQ03164 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KMT2AQ03164 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KMT2AQ03164 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KMT2AQ03164 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KMT2AQ03164 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KMT2AQ03164 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KMT2AQ03164 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KMT2AQ03164 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KMT2AQ03164 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KMT2AQ03164 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KMT2AQ03164 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KMT2AQ03164 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KMT2AQ03164 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KMT2AQ03164 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KMT2AQ03164 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KMT2AQ03164 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KMT2AQ03164 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KMT2AQ03164 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KMT2AQ03164 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KMT2AQ03164 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KMT2AQ03164 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KMT2AQ03164 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KMT2AQ03164 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KMT2AQ03164 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KMT2AQ03164 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KMT2AQ03164 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KMT2AQ03164 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KMT2AQ03164 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KMT2AQ03164 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KMT2AQ03164 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KMT2AQ03164 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KMT2AQ03164 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KMT2AQ03164 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KMT2AQ03164 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KMT2AQ03164 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KMT2AQ03164 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms