Protein–RNA interactions for Protein: P68543

UBXN2A, UBX domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2AP68543 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBXN2AP68543 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBXN2AP68543 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBXN2AP68543 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBXN2AP68543 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBXN2AP68543 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBXN2AP68543 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBXN2AP68543 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
UBXN2AP68543 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBXN2AP68543 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBXN2AP68543 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBXN2AP68543 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBXN2AP68543 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBXN2AP68543 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBXN2AP68543 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBXN2AP68543 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBXN2AP68543 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
UBXN2AP68543 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBXN2AP68543 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBXN2AP68543 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBXN2AP68543 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBXN2AP68543 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBXN2AP68543 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBXN2AP68543 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBXN2AP68543 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
UBXN2AP68543 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBXN2AP68543 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBXN2AP68543 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBXN2AP68543 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBXN2AP68543 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBXN2AP68543 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBXN2AP68543 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBXN2AP68543 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
UBXN2AP68543 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
UBXN2AP68543 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBXN2AP68543 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBXN2AP68543 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
UBXN2AP68543 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBXN2AP68543 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBXN2AP68543 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBXN2AP68543 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBXN2AP68543 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBXN2AP68543 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBXN2AP68543 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBXN2AP68543 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBXN2AP68543 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBXN2AP68543 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBXN2AP68543 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBXN2AP68543 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBXN2AP68543 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBXN2AP68543 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UBXN2AP68543 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
UBXN2AP68543 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UBXN2AP68543 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UBXN2AP68543 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBXN2AP68543 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBXN2AP68543 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBXN2AP68543 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBXN2AP68543 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBXN2AP68543 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UBXN2AP68543 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UBXN2AP68543 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UBXN2AP68543 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
UBXN2AP68543 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
UBXN2AP68543 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UBXN2AP68543 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
UBXN2AP68543 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
UBXN2AP68543 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UBXN2AP68543 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UBXN2AP68543 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UBXN2AP68543 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBXN2AP68543 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBXN2AP68543 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBXN2AP68543 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBXN2AP68543 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
UBXN2AP68543 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
UBXN2AP68543 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
UBXN2AP68543 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
UBXN2AP68543 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
UBXN2AP68543 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UBXN2AP68543 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UBXN2AP68543 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
UBXN2AP68543 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UBXN2AP68543 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UBXN2AP68543 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UBXN2AP68543 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
UBXN2AP68543 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
UBXN2AP68543 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
UBXN2AP68543 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
UBXN2AP68543 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UBXN2AP68543 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UBXN2AP68543 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
UBXN2AP68543 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
UBXN2AP68543 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
UBXN2AP68543 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
UBXN2AP68543 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
UBXN2AP68543 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
UBXN2AP68543 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
UBXN2AP68543 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
UBXN2AP68543 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms