Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNRPD2P62316 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNRPD2P62316 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNRPD2P62316 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNRPD2P62316 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNRPD2P62316 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNRPD2P62316 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNRPD2P62316 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNRPD2P62316 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNRPD2P62316 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNRPD2P62316 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNRPD2P62316 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNRPD2P62316 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNRPD2P62316 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNRPD2P62316 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNRPD2P62316 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SNRPD2P62316 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNRPD2P62316 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNRPD2P62316 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNRPD2P62316 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPD2P62316 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPD2P62316 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPD2P62316 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPD2P62316 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPD2P62316 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNRPD2P62316 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNRPD2P62316 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SNRPD2P62316 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNRPD2P62316 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNRPD2P62316 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNRPD2P62316 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNRPD2P62316 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNRPD2P62316 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNRPD2P62316 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SNRPD2P62316 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNRPD2P62316 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNRPD2P62316 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNRPD2P62316 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNRPD2P62316 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNRPD2P62316 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNRPD2P62316 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SNRPD2P62316 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SNRPD2P62316 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNRPD2P62316 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNRPD2P62316 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms