Protein–RNA interactions for Protein: P61601

NCALD, Neurocalcin-delta, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCALDP61601 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCALDP61601 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCALDP61601 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCALDP61601 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCALDP61601 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCALDP61601 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCALDP61601 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCALDP61601 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCALDP61601 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCALDP61601 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NCALDP61601 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NCALDP61601 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCALDP61601 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCALDP61601 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCALDP61601 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NCALDP61601 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCALDP61601 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCALDP61601 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCALDP61601 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCALDP61601 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCALDP61601 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCALDP61601 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCALDP61601 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCALDP61601 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCALDP61601 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCALDP61601 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCALDP61601 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCALDP61601 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCALDP61601 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCALDP61601 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCALDP61601 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCALDP61601 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCALDP61601 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCALDP61601 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCALDP61601 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCALDP61601 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCALDP61601 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCALDP61601 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCALDP61601 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCALDP61601 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCALDP61601 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCALDP61601 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCALDP61601 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCALDP61601 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCALDP61601 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCALDP61601 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCALDP61601 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NCALDP61601 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCALDP61601 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCALDP61601 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCALDP61601 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCALDP61601 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCALDP61601 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCALDP61601 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NCALDP61601 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCALDP61601 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCALDP61601 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCALDP61601 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCALDP61601 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCALDP61601 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCALDP61601 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCALDP61601 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCALDP61601 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCALDP61601 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCALDP61601 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCALDP61601 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCALDP61601 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCALDP61601 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCALDP61601 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCALDP61601 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCALDP61601 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCALDP61601 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCALDP61601 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCALDP61601 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCALDP61601 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCALDP61601 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCALDP61601 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCALDP61601 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCALDP61601 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCALDP61601 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCALDP61601 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCALDP61601 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NCALDP61601 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCALDP61601 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCALDP61601 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCALDP61601 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NCALDP61601 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NCALDP61601 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NCALDP61601 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCALDP61601 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCALDP61601 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCALDP61601 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCALDP61601 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCALDP61601 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCALDP61601 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCALDP61601 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCALDP61601 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCALDP61601 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCALDP61601 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCALDP61601 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms