Protein–RNA interactions for Protein: P60953

CDC42, Cell division control protein 42 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42P60953 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC42P60953 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC42P60953 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC42P60953 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC42P60953 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC42P60953 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC42P60953 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC42P60953 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC42P60953 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC42P60953 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC42P60953 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC42P60953 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDC42P60953 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDC42P60953 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CDC42P60953 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDC42P60953 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC42P60953 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC42P60953 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC42P60953 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC42P60953 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC42P60953 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42P60953 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42P60953 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42P60953 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42P60953 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42P60953 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42P60953 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42P60953 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42P60953 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42P60953 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42P60953 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC42P60953 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC42P60953 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC42P60953 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC42P60953 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC42P60953 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC42P60953 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC42P60953 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDC42P60953 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDC42P60953 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDC42P60953 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CDC42P60953 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDC42P60953 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDC42P60953 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDC42P60953 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDC42P60953 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDC42P60953 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDC42P60953 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDC42P60953 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDC42P60953 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDC42P60953 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDC42P60953 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDC42P60953 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDC42P60953 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CDC42P60953 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CDC42P60953 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42P60953 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42P60953 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42P60953 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42P60953 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42P60953 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42P60953 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42P60953 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42P60953 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42P60953 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42P60953 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42P60953 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42P60953 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42P60953 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42P60953 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42P60953 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42P60953 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42P60953 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42P60953 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42P60953 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42P60953 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42P60953 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42P60953 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42P60953 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42P60953 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42P60953 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42P60953 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42P60953 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42P60953 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42P60953 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42P60953 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42P60953 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42P60953 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42P60953 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42P60953 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC42P60953 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC42P60953 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC42P60953 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC42P60953 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC42P60953 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC42P60953 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC42P60953 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC42P60953 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC42P60953 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC42P60953 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 325.1 ms