Protein–RNA interactions for Protein: P59025

RTP1, Receptor-transporting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP1P59025 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RTP1P59025 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RTP1P59025 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RTP1P59025 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RTP1P59025 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RTP1P59025 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RTP1P59025 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RTP1P59025 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RTP1P59025 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RTP1P59025 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RTP1P59025 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RTP1P59025 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RTP1P59025 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RTP1P59025 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RTP1P59025 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RTP1P59025 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RTP1P59025 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RTP1P59025 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RTP1P59025 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RTP1P59025 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RTP1P59025 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RTP1P59025 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RTP1P59025 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RTP1P59025 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RTP1P59025 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RTP1P59025 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RTP1P59025 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RTP1P59025 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RTP1P59025 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RTP1P59025 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RTP1P59025 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RTP1P59025 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RTP1P59025 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RTP1P59025 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RTP1P59025 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RTP1P59025 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RTP1P59025 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RTP1P59025 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RTP1P59025 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RTP1P59025 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RTP1P59025 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RTP1P59025 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RTP1P59025 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RTP1P59025 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RTP1P59025 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RTP1P59025 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RTP1P59025 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RTP1P59025 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RTP1P59025 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RTP1P59025 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RTP1P59025 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RTP1P59025 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RTP1P59025 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RTP1P59025 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RTP1P59025 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RTP1P59025 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RTP1P59025 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RTP1P59025 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RTP1P59025 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RTP1P59025 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RTP1P59025 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RTP1P59025 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RTP1P59025 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RTP1P59025 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RTP1P59025 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RTP1P59025 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RTP1P59025 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RTP1P59025 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RTP1P59025 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RTP1P59025 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RTP1P59025 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTP1P59025 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTP1P59025 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTP1P59025 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTP1P59025 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTP1P59025 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RTP1P59025 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RTP1P59025 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RTP1P59025 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RTP1P59025 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RTP1P59025 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RTP1P59025 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RTP1P59025 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RTP1P59025 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RTP1P59025 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RTP1P59025 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RTP1P59025 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RTP1P59025 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RTP1P59025 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RTP1P59025 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RTP1P59025 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RTP1P59025 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RTP1P59025 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RTP1P59025 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RTP1P59025 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RTP1P59025 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RTP1P59025 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RTP1P59025 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RTP1P59025 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RTP1P59025 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.1 ms