Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
BRPF1P55201 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
BRPF1P55201 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
BRPF1P55201 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
BRPF1P55201 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
BRPF1P55201 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
BRPF1P55201 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
BRPF1P55201 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
BRPF1P55201 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
BRPF1P55201 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
BRPF1P55201 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
BRPF1P55201 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
BRPF1P55201 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
BRPF1P55201 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
BRPF1P55201 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
BRPF1P55201 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
BRPF1P55201 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
BRPF1P55201 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
BRPF1P55201 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
BRPF1P55201 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
BRPF1P55201 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
BRPF1P55201 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
BRPF1P55201 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
BRPF1P55201 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
BRPF1P55201 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
BRPF1P55201 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
BRPF1P55201 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
BRPF1P55201 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
BRPF1P55201 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
BRPF1P55201 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
BRPF1P55201 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
BRPF1P55201 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
BRPF1P55201 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
BRPF1P55201 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
BRPF1P55201 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
BRPF1P55201 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
BRPF1P55201 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
BRPF1P55201 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
BRPF1P55201 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
BRPF1P55201 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
BRPF1P55201 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
BRPF1P55201 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
BRPF1P55201 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
BRPF1P55201 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
BRPF1P55201 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
BRPF1P55201 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
BRPF1P55201 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
BRPF1P55201 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
BRPF1P55201 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
BRPF1P55201 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
BRPF1P55201 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
BRPF1P55201 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
BRPF1P55201 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
BRPF1P55201 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
BRPF1P55201 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
BRPF1P55201 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
BRPF1P55201 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
BRPF1P55201 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
BRPF1P55201 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
BRPF1P55201 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
BRPF1P55201 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
BRPF1P55201 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
BRPF1P55201 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
BRPF1P55201 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
BRPF1P55201 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
BRPF1P55201 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
BRPF1P55201 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
BRPF1P55201 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
BRPF1P55201 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
BRPF1P55201 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
BRPF1P55201 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
BRPF1P55201 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
BRPF1P55201 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
BRPF1P55201 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
BRPF1P55201 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
BRPF1P55201 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
BRPF1P55201 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
BRPF1P55201 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
BRPF1P55201 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
BRPF1P55201 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
BRPF1P55201 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
BRPF1P55201 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
BRPF1P55201 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
BRPF1P55201 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
BRPF1P55201 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
BRPF1P55201 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
BRPF1P55201 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
BRPF1P55201 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
BRPF1P55201 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
BRPF1P55201 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
BRPF1P55201 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
BRPF1P55201 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
BRPF1P55201 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
BRPF1P55201 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
BRPF1P55201 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
BRPF1P55201 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
BRPF1P55201 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
BRPF1P55201 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
BRPF1P55201 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
BRPF1P55201 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms