Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD4P55036 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD4P55036 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD4P55036 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD4P55036 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD4P55036 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD4P55036 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD4P55036 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD4P55036 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD4P55036 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD4P55036 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD4P55036 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD4P55036 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD4P55036 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD4P55036 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD4P55036 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD4P55036 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD4P55036 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD4P55036 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD4P55036 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD4P55036 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD4P55036 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD4P55036 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD4P55036 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD4P55036 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD4P55036 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD4P55036 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD4P55036 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD4P55036 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD4P55036 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD4P55036 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD4P55036 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD4P55036 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD4P55036 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD4P55036 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD4P55036 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD4P55036 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD4P55036 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD4P55036 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD4P55036 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD4P55036 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD4P55036 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD4P55036 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD4P55036 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD4P55036 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD4P55036 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD4P55036 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD4P55036 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD4P55036 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD4P55036 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD4P55036 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD4P55036 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD4P55036 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD4P55036 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD4P55036 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD4P55036 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD4P55036 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD4P55036 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD4P55036 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD4P55036 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD4P55036 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD4P55036 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD4P55036 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD4P55036 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD4P55036 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD4P55036 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD4P55036 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD4P55036 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD4P55036 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD4P55036 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD4P55036 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD4P55036 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD4P55036 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD4P55036 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD4P55036 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD4P55036 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD4P55036 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD4P55036 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD4P55036 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD4P55036 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD4P55036 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD4P55036 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD4P55036 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD4P55036 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD4P55036 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD4P55036 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD4P55036 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD4P55036 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD4P55036 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD4P55036 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD4P55036 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD4P55036 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD4P55036 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD4P55036 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD4P55036 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD4P55036 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD4P55036 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD4P55036 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD4P55036 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD4P55036 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms