Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP11P51784 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP11P51784 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP11P51784 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP11P51784 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP11P51784 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP11P51784 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP11P51784 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP11P51784 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP11P51784 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP11P51784 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP11P51784 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP11P51784 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
USP11P51784 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP11P51784 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP11P51784 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP11P51784 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP11P51784 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP11P51784 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP11P51784 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
USP11P51784 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
USP11P51784 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP11P51784 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
USP11P51784 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP11P51784 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP11P51784 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP11P51784 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
USP11P51784 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP11P51784 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP11P51784 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP11P51784 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP11P51784 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP11P51784 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP11P51784 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP11P51784 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP11P51784 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP11P51784 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP11P51784 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP11P51784 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP11P51784 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP11P51784 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP11P51784 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP11P51784 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP11P51784 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP11P51784 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP11P51784 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP11P51784 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP11P51784 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP11P51784 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP11P51784 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
USP11P51784 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP11P51784 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP11P51784 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP11P51784 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP11P51784 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
USP11P51784 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP11P51784 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
USP11P51784 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP11P51784 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
USP11P51784 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
USP11P51784 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP11P51784 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
USP11P51784 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP11P51784 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP11P51784 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP11P51784 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP11P51784 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP11P51784 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP11P51784 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP11P51784 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP11P51784 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP11P51784 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP11P51784 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP11P51784 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP11P51784 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP11P51784 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP11P51784 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP11P51784 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP11P51784 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP11P51784 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP11P51784 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP11P51784 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP11P51784 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP11P51784 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP11P51784 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP11P51784 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP11P51784 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP11P51784 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP11P51784 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP11P51784 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP11P51784 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP11P51784 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP11P51784 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP11P51784 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP11P51784 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP11P51784 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP11P51784 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP11P51784 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP11P51784 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP11P51784 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms