Protein–RNA interactions for Protein: P39005

KRE9, Cell wall synthesis protein KRE9, yeast

Predictions only

Length 276 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KRE9	P39005	TIF34	YMR146C	1044 nt		4.74	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	TAF9	YMR236W	474 nt		4.74	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	RUF23	RUF23	254 nt		4.74	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	CCC2	YDR270W	3015 nt		4.73	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	YIL055C	YIL055C	1884 nt		4.73	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	SPO12	YHR152W	522 nt		4.73	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	LYS1	YIR034C	1122 nt		4.73	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	AIM24	YJR080C	1185 nt		4.73	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	YKR075C	YKR075C	924 nt		4.73	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	YET2	YMR040W	483 nt		4.73	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	ARR1	YPR199C	885 nt		4.73	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	PEX3	YDR329C	1326 nt		4.72	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	SAS4	YDR181C	1446 nt		4.72	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	IMA5	YJL216C	1746 nt		4.72	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	TFC6	YDR362C	2019 nt		4.72	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	MDE1	YJR024C	735 nt		4.72	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	YLR123C	YLR123C	330 nt		4.72	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	YLR312C	YLR312C	1197 nt		4.72	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	MRPS18	YNL306W	654 nt		4.72	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	RKI1	YOR095C	777 nt		4.72	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	LDB16	YCL005W	771 nt		4.72	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	RBS1	YDL189W	1374 nt		4.72	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	HER2	YMR293C	1395 nt		4.72	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	YPL245W	YPL245W	1365 nt		4.72	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	MSS116	YDR194C	1995 nt		4.72	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	BPL1	YDL141W	2073 nt		4.72	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	PRY3	YJL078C	2646 nt		4.72	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	ACS1	YAL054C	2142 nt		4.72	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	RPN5	YDL147W	1338 nt		4.72	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	RTN1	YDR233C	888 nt		4.71	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	VMA3	YEL027W	483 nt		4.71	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	GFD1	YMR255W	567 nt		4.71	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	CTF19	YPL018W	1110 nt		4.71	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	TPO3	YPR156C	1869 nt		4.71	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	GUS1	YGL245W	2127 nt		4.7	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	CHS5	YLR330W	2016 nt		4.7	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	YGR054W	YGR054W	1929 nt		4.7	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	SAL1	YNL083W	1485 nt		4.7	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	CCT8	YJL008C	1707 nt		4.7	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	EDC1	YGL222C	528 nt		4.7	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	YIR043C	YIR043C	693 nt		4.7	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	ICS3	YJL077C	396 nt		4.7	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	SED5	YLR026C	1023 nt		4.7	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	PET112	YBL080C	1626 nt		4.7	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	ARE2	YNR019W	1929 nt		4.7	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	RKM4	YDR257C	1485 nt		4.69	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	LAG2	YOL025W	1983 nt		4.69	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	YDL085C-A	YDL085C-A	207 nt		4.69	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	PPM1	YDR435C	987 nt		4.69	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	GCG1	YER163C	699 nt		4.69	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	QCR6	YFR033C	444 nt		4.69	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	OM45	YIL136W	1182 nt		4.69	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	DUS4	YLR405W	1104 nt		4.69	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	YML6	YML025C	861 nt		4.69	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	COQ3	YOL096C	939 nt		4.69	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	POS5	YPL188W	1245 nt		4.69	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	CLD1	YGR110W	1338 nt		4.69	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	snR57	snR57	88 nt		4.68	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	CRP1	YHR146W	1398 nt		4.67	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	CTF18	YMR078C	2226 nt		4.67	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	MED2	YDL005C	1296 nt		4.67	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	YGL235W	YGL235W	537 nt		4.67	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	YGR066C	YGR066C	879 nt		4.67	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	GCV3	YAL044C	513 nt		4.67	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	MHT1	YLL062C	975 nt		4.67	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	ELC1	YPL046C	300 nt		4.67	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	ECM2	YBR065C	1095 nt		4.67	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	TIP41	YPR040W	1071 nt		4.67	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	ECM31	YBR176W	939 nt		4.67	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	BSC5	YNR069C	1470 nt		4.67	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	GPD2	YOL059W	1323 nt		4.67	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	PFK2	YMR205C	2880 nt		4.67	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	SPO77	YLR341W	1434 nt		4.66	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	YIL029W-A	YIL029W-A	372 nt		4.66	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	QCR8	YJL166W	285 nt		4.66	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	YJR056C	YJR056C	711 nt		4.66	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	MEH1	YKR007W	555 nt		4.66	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	YKR045C	YKR045C	552 nt		4.66	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	YLR283W	YLR283W	945 nt		4.66	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	ILV6	YCL009C	930 nt		4.66	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	RMD9	YGL107C	1941 nt		4.66	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	DAL4	YIR028W	1908 nt		4.66	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	ERG8	YMR220W	1356 nt		4.65	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	PMT2	YAL023C	2280 nt		4.65	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	FRE5	YOR384W	2085 nt		4.65	□□□□□ -1.66
KRE9	P39005	YDR509W	YDR509W	348 nt		4.65	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	DMA1	YHR115C	1251 nt		4.65	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	LCB3	YJL134W	1230 nt		4.65	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	ADD66	YKL206C	804 nt		4.65	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	YLR036C	YLR036C	612 nt		4.65	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	TSR2	YLR435W	618 nt		4.65	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	PPA2	YMR267W	933 nt		4.65	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	YPL168W	YPL168W	1293 nt		4.65	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	SPS22	YCL048W	1392 nt		4.65	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	PPT1	YGR123C	1542 nt		4.64	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	VPS61	YDR136C	573 nt		4.64	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	GTO1	YGR154C	1071 nt		4.64	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	ERP2	YAL007C	648 nt		4.64	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	SPC42	YKL042W	1092 nt		4.64	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	DPH5	YLR172C	903 nt		4.64	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 140.8 ms