Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ABCD1P33897 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ABCD1P33897 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCD1P33897 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCD1P33897 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCD1P33897 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCD1P33897 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCD1P33897 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCD1P33897 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCD1P33897 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCD1P33897 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCD1P33897 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCD1P33897 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCD1P33897 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCD1P33897 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCD1P33897 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCD1P33897 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCD1P33897 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCD1P33897 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ABCD1P33897 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ABCD1P33897 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ABCD1P33897 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ABCD1P33897 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ABCD1P33897 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ABCD1P33897 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCD1P33897 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCD1P33897 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCD1P33897 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCD1P33897 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCD1P33897 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCD1P33897 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCD1P33897 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCD1P33897 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ABCD1P33897 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ABCD1P33897 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ABCD1P33897 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ABCD1P33897 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ABCD1P33897 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCD1P33897 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCD1P33897 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCD1P33897 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCD1P33897 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCD1P33897 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCD1P33897 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCD1P33897 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCD1P33897 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCD1P33897 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCD1P33897 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCD1P33897 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCD1P33897 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCD1P33897 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCD1P33897 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCD1P33897 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCD1P33897 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCD1P33897 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCD1P33897 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCD1P33897 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCD1P33897 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCD1P33897 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCD1P33897 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCD1P33897 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCD1P33897 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCD1P33897 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCD1P33897 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCD1P33897 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCD1P33897 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCD1P33897 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCD1P33897 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCD1P33897 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCD1P33897 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCD1P33897 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCD1P33897 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCD1P33897 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCD1P33897 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCD1P33897 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCD1P33897 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCD1P33897 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCD1P33897 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCD1P33897 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCD1P33897 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCD1P33897 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCD1P33897 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCD1P33897 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCD1P33897 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCD1P33897 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCD1P33897 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCD1P33897 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCD1P33897 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCD1P33897 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCD1P33897 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCD1P33897 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCD1P33897 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCD1P33897 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCD1P33897 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCD1P33897 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCD1P33897 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCD1P33897 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ABCD1P33897 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ABCD1P33897 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ABCD1P33897 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms