Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCKBRP32239 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCKBRP32239 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCKBRP32239 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCKBRP32239 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCKBRP32239 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCKBRP32239 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCKBRP32239 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCKBRP32239 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCKBRP32239 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCKBRP32239 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCKBRP32239 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCKBRP32239 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCKBRP32239 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCKBRP32239 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCKBRP32239 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCKBRP32239 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCKBRP32239 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCKBRP32239 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCKBRP32239 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCKBRP32239 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCKBRP32239 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCKBRP32239 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCKBRP32239 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCKBRP32239 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCKBRP32239 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCKBRP32239 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCKBRP32239 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCKBRP32239 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCKBRP32239 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCKBRP32239 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCKBRP32239 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCKBRP32239 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCKBRP32239 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCKBRP32239 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCKBRP32239 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCKBRP32239 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCKBRP32239 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCKBRP32239 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCKBRP32239 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCKBRP32239 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCKBRP32239 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCKBRP32239 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCKBRP32239 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCKBRP32239 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCKBRP32239 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCKBRP32239 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCKBRP32239 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCKBRP32239 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCKBRP32239 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCKBRP32239 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCKBRP32239 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCKBRP32239 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCKBRP32239 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCKBRP32239 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCKBRP32239 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCKBRP32239 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCKBRP32239 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCKBRP32239 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCKBRP32239 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCKBRP32239 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CCKBRP32239 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCKBRP32239 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCKBRP32239 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCKBRP32239 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCKBRP32239 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCKBRP32239 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCKBRP32239 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCKBRP32239 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCKBRP32239 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCKBRP32239 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCKBRP32239 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCKBRP32239 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCKBRP32239 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCKBRP32239 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCKBRP32239 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCKBRP32239 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCKBRP32239 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCKBRP32239 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCKBRP32239 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCKBRP32239 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCKBRP32239 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCKBRP32239 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCKBRP32239 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCKBRP32239 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCKBRP32239 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCKBRP32239 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCKBRP32239 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCKBRP32239 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCKBRP32239 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCKBRP32239 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCKBRP32239 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCKBRP32239 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCKBRP32239 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCKBRP32239 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCKBRP32239 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCKBRP32239 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCKBRP32239 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCKBRP32239 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCKBRP32239 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms