Protein–RNA interactions for Protein: P30048

PRDX3, Thioredoxin-dependent peroxide reductase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDX3P30048 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDX3P30048 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDX3P30048 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDX3P30048 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDX3P30048 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDX3P30048 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDX3P30048 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDX3P30048 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDX3P30048 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDX3P30048 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDX3P30048 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDX3P30048 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRDX3P30048 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRDX3P30048 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PRDX3P30048 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PRDX3P30048 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRDX3P30048 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRDX3P30048 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRDX3P30048 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRDX3P30048 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDX3P30048 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDX3P30048 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDX3P30048 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDX3P30048 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDX3P30048 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDX3P30048 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDX3P30048 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDX3P30048 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDX3P30048 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDX3P30048 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDX3P30048 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDX3P30048 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDX3P30048 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDX3P30048 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDX3P30048 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDX3P30048 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDX3P30048 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDX3P30048 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDX3P30048 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDX3P30048 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDX3P30048 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDX3P30048 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDX3P30048 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDX3P30048 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDX3P30048 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDX3P30048 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDX3P30048 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDX3P30048 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDX3P30048 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDX3P30048 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDX3P30048 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDX3P30048 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDX3P30048 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDX3P30048 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDX3P30048 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDX3P30048 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDX3P30048 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDX3P30048 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDX3P30048 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRDX3P30048 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDX3P30048 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDX3P30048 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDX3P30048 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDX3P30048 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDX3P30048 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDX3P30048 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDX3P30048 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDX3P30048 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDX3P30048 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDX3P30048 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDX3P30048 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDX3P30048 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDX3P30048 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDX3P30048 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDX3P30048 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDX3P30048 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDX3P30048 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDX3P30048 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDX3P30048 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDX3P30048 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDX3P30048 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDX3P30048 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDX3P30048 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDX3P30048 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDX3P30048 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDX3P30048 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDX3P30048 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDX3P30048 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDX3P30048 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDX3P30048 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDX3P30048 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDX3P30048 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDX3P30048 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDX3P30048 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDX3P30048 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDX3P30048 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDX3P30048 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDX3P30048 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDX3P30048 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDX3P30048 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms