Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSMA4P25789 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMA4P25789 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMA4P25789 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMA4P25789 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMA4P25789 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMA4P25789 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMA4P25789 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMA4P25789 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMA4P25789 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMA4P25789 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMA4P25789 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMA4P25789 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMA4P25789 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMA4P25789 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMA4P25789 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMA4P25789 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMA4P25789 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMA4P25789 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMA4P25789 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMA4P25789 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMA4P25789 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMA4P25789 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMA4P25789 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMA4P25789 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMA4P25789 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMA4P25789 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMA4P25789 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMA4P25789 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMA4P25789 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMA4P25789 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMA4P25789 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMA4P25789 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMA4P25789 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMA4P25789 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMA4P25789 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMA4P25789 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMA4P25789 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMA4P25789 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMA4P25789 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMA4P25789 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMA4P25789 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMA4P25789 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMA4P25789 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMA4P25789 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMA4P25789 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMA4P25789 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMA4P25789 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMA4P25789 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMA4P25789 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMA4P25789 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMA4P25789 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMA4P25789 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMA4P25789 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMA4P25789 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMA4P25789 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMA4P25789 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMA4P25789 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMA4P25789 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMA4P25789 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMA4P25789 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMA4P25789 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMA4P25789 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMA4P25789 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMA4P25789 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMA4P25789 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMA4P25789 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms